В 1480 году Николо-Ленивец стал центром событий Великого Стояния на реке Угре, которое ознаменовало окончание татаро-монгольского ига. В память об этих событиях была возведена деревянная часовня. В 1802 году на ее месте помещик Никита Алексеевич Муромцев построил большой каменный храм с колокольней, который долгое время оставался важнейшим архитектурным, художественным и духовным центром региона. Центральный престол храма был освящен в честь Святой Живоначальной Троицы, а приделы, в честь святителя Николая и великомученика Никиты, вероятно, в честь небесного покровителя создателя храма. Один из приделов дал храму название Никольский, что также добавилось к названию села. Приход включал населенные пункты Сергиевской волости Медынского уезда: село Николо-Ленивец и деревни Андреевка, Беляйково, Звизжи, Марьино, Межмерово (с 1919 года, Некрасово), Шадеево, Шестаково. В 1931 году храм был закрыт и использовался для нужд местного колхоза, а по данным 1961 года в его здании находился молочный завод.

В 1992 году архиепископ Калужский и Боровский Климент обратился к властям с просьбой вернуть храм Церкви. 5 июня 1992 года постановлением Администрации Калужской области №144 храм был передан Калужской епархии. В настоящее время ведется его восстановление, и храм функционирует как Архиерейское Подворье.