Храм Святого Духа в деревне Фленово, расположенной в Смоленской области, был построен в начале XX века на средства княгини Тенишевой. История его создания начинается в конце XIX века, когда Мария Клавдиевна приобрела эту территорию и включила её в своё имение Талашкино. Она решила возвести здесь новую церковь.

Для проектирования храма был приглашён художник Сергей Васильевич Малютин, который, по просьбе заказчицы, взял за образец храм в подмосковном Абрамцево. Это был первый архитектурный проект Малютина, который согласился на работу по просьбе их общего друга Врубеля.

В 1899 году Малютин лично посетил Талашкино, где провёл несколько месяцев, создавая множество эскизов. Затем Иван Фёдорович Барщевский, под руководством княгини, создал макет храма.

Фундамент был торжественно заложен 7 сентября 1900 года, а основные строительные работы велись с 1902 по 1905 год. Интерьеры храма расписал известный художник Николай Рерих, а в оформлении участвовали его сыновья и ученики.

Результаты работы высоко оценили многочисленные именитые гости княгини Тенишевой. Однако полностью завершить оформление храма Святого Духа княгиня не успела. После большевистского переворота она была вынуждена эмигрировать, а её имущество было конфисковано новой властью.

В 1924 году храм был осквернён и разграблен. Из церковного склепа большевики вынесли тело Вячеслава Тенишева и надругались над ним на глазах у местных жителей.

За последующие десятилетия значительная часть росписи храма была утрачена. Лишь в 2001 году началась реставрация, которая продолжается до сих пор.