Храм расположен в центре села Супонево на высоком берегу реки Десна. В XVI-XVII веках здесь находился женский Георгиевский монастырь с деревянной церковью, который был приписан к Свенскому монастырю. Позже это место стало владением Свенского монастыря с приходским храмом. Современное здание храма в Супонево было возведено на средства прихожан в 1828-1831 годах, заменив собой старую деревянную церковь. Однако внутреннее убранство храма было завершено позже. В 1847 году освятили придельный алтарь в честь Святого Георгия Победоносца, а в 1852 году, главный алтарь во имя Спаса Нерукотворного. Храм оставался действующим, за исключением периода 1941-1943 годов, когда во время фашистской оккупации в нем была устроена конюшня.