Пещерная церковь в Дивногорском Успенском монастыре, посвященная Рождеству святого Иоанна Предтечи, высечена в скале на вершине горы, на высоте более 40 саженей над уровнем реки Дон. Вход в нее прямой и просторный.

Внутреннее пространство церкви разделено на три части, а алтарь отделен природными колоннами. Между церковью и алтарем проделаны три отверстия для царских врат и боковых дверей. Алтарь возвышается над церковью на несколько ступеней, вырезанных в меловой горе. Горнее место напоминает кафедру для архиерея, что, вероятно, предусматривалось для архиерейских служб.

Над горним местом на полуовальной меловой доске изображен восьмиконечный крест с надписью: «Освятися жертвенник Господа Бога и Спаса нашего И. Христа во храме рождества Иоанна Предтечи, при державе благочестивейших великих Государей и Царей и великих Князей Иоанна Алексеевича и Петра Алексеевича всея Руси, по благословению великого господина преосвященного Авраамия, митрополита Белоградского и Обоянского, в лето 7102, от Рождества Христова 1693, индикта I, месяца ноября, на память святых мучеников 33-х».

Престол и клиросы выполнены из камня и примыкают к стенам пещеры. Вместимость клиросов небольшая, рассчитана на 6-8 человек. Алтарь достаточно просторный, с левой стороны в нем вырезана небольшая комната, напоминающая пономарню. Длина церкви с алтарем составляет 40 аршин, ширина, 17 аршин. На вершине мелового столпа, над церковью, установлены позолоченные глава и крест.

После закрытия Дивногорского монастыря в 1788 году пещерная церковь долгое время оставалась в запустении. В 1817 году епископ Воронежский Епифаний разрешил ее освятить и проводить в ней богослужения.

Однако и после этого церковь нуждалась в ремонте и была обновлена. После установки нового иконостаса она была освящена архиепископом Воронежским Антонием 28 июля 1846 года. В последнее время церковь была вновь восстановлена, в ней установлен иконостас, а иконы написаны на металлических досках.

Рядом с пещерной церковью находится каменный столп, который, вероятно, планировали превратить в колокольню с пролетами и кельями, но это привело к разрушению столпа.