L'église troglodyte du monastère de Divnogorsk, dédiée à la Nativité de Saint Jean Baptiste, est taillée dans la roche au sommet d'une montagne, à plus de 40 sazhens au-dessus du niveau de la rivière Don. L'entrée est directe et spacieuse.

L'espace intérieur de l'église est divisé en trois parties, et l'autel est séparé par des colonnes naturelles. Entre l'église et l'autel, trois ouvertures sont faites pour les portes royales et les portes latérales. L'autel s'élève au-dessus de l'église sur plusieurs marches taillées dans la montagne de craie. L'endroit supérieur ressemble à un pupitre pour l'archevêque, ce qui était probablement prévu pour les services archiépiscopaux.

Au-dessus de l'endroit supérieur, sur une planche de craie en forme de demi-ovale, est représentée une croix à huit branches avec l'inscription : « Que l'autel du Seigneur Dieu et Sauveur notre J. Christ dans le temple de la Nativité de Saint Jean Baptiste soit sanctifié, sous le règne des plus pieux grands Souverains et Rois et grands Princes Ioann Alexeïevitch et Pierre Alexeïevitch de toute la Russie, par la bénédiction du grand seigneur, le très révérend Abraham, métropolite de Belgorod et Oboyansk, en l'an 7102, depuis la Nativité du Christ 1693, indiction I, mois de novembre, en mémoire des saints martyrs 33. »

Le trône et les chœurs sont en pierre et adjacents aux murs de la grotte. La capacité des chœurs est petite, prévue pour 6-8 personnes. L'autel est assez spacieux, avec sur le côté gauche une petite pièce taillée, ressemblant à une sacristie. La longueur de l'église avec l'autel est de 40 arshins, la largeur de 17 arshins. Au sommet du pilier de craie, au-dessus de l'église, sont installés un dôme doré et une croix.

Après la fermeture du monastère de Divnogorsk en 1788, l'église troglodyte est restée longtemps à l'abandon. En 1817, l'évêque de Voronej, Épiphane, a permis de la consacrer et d'y célébrer des offices.

Cependant, même après cela, l'église avait besoin de réparations et a été rénovée. Après l'installation d'un nouvel iconostase, elle a été consacrée par l'archevêque de Voronej, Antoine, le 28 juillet 1846. Récemment, l'église a été à nouveau restaurée, un iconostase y a été installé, et les icônes ont été peintes sur des planches métalliques.

Près de l'église troglodyte se trouve un pilier en pierre, qui, probablement, était prévu pour être transformé en clocher avec des travées et des cellules, mais cela a conduit à la destruction du pilier.