Название церкви сегодня вызывает вопросы, поскольку то, что мы называем Ходынским полем, расположено в другом месте, внутри окружной железной дороги и в двух километрах от храма. Однако в XIX веке Ходынское поле занимало гораздо большую площадь и простиралось почти до Щукина. В 1900-е годы окружная железная дорога разделила его на две части. В первой половине XIX века на Ходынке начали появляться военные лагеря, которые разместились в восточной части поля, ближе к Щукину. В начале XX века эта часть называлась Военным полем, а с 1922 года, Октябрьским полем. В 1930-е годы здесь начали строить бараки, а позже, в 1940-50-е годы, появились сталинские дома. Военные лагеря находились севернее нынешней улицы Маршала Рыбалко. С севера от них располагалась Большая Всехсвятская роща, от которой до наших дней сохранилась лишь небольшая часть.

Церковь была построена на территории военных лагерей, при Московском военном госпитале, и основными прихожанами стали юнкера и офицеры. Первый храм, посвященный святому Пантелеймону, был деревянным и появился в 1897 году. Его архитектором был И. Молчанов. Нынешний храм возвели рядом с деревянным в 1902 году и посвятили иконе «Скоропослушница», к которой обращались в бедах и чрезвычайных ситуациях, таких как кораблекрушения, пожары и наводнения.

Церковь была заложена 8 июня 1901 года, а 1 августа 1902 года ее освятили. Архитектор, к сожалению, неизвестен. Газета «Московские церковные ведомости» сообщала, что во время богослужения, которое проводил протопресвитер армии и флота А. Желобовский, присутствовали Великий Князь Сергей Александрович и Великая Княгиня Елизавета Федоровна. Сергей Александрович в то время был генерал-губернатором Москвы.

Храм выполнен в неорусском стиле, стилизован под русское узорочье XVII века. Это касается деталей, таких как арочный портал с юго-западной стороны. В Москве есть несколько прототипов этого портала, например, у церквей Косьмы и Дамиана в Старых Панех, Троицы в Листах и других. Окна с килевидными завершениями над порталом также характерны для допетровского узорочья. Однако звонница такого типа в XVII веке строилась отдельно от церкви. Вертикальные «ширинки» по краям фасада и ряды квадратных ниш с ромбиками в центре также заимствованы из узорочья, но в XVII веке такие элементы использовались в украшении обходных галерей.

Основная часть церкви представляет собой четверик с одноглавым завершением. Под карнизом находится пояс из кокошников, которые слишком мелкие по сравнению с прототипами XVII века, что отсылает к аркатурным поясам XV века, например, у церкви Ризоположения в Кремле.

После революции деревянную церковь снесли, а кирпичную закрыли, обезглавили и разрушили верхушку звонницы. Внутри разместили склады, последний из которых, в 1980-е годы, принадлежал предприятию «Союзсамоцветы». Церковь вновь освятили в 1992 году и отреставрировали. Однако при реставрации изменили изначальный облик здания: краснокирпичные стены оштукатурили.