Река Черемуха играла важную роль в жизни рыбинского края. В XVII-XVIII веках земли, расположенные к юго-востоку от Рыбной слободы, назывались Черемошской волостью или Черемхой. Здесь, вдоль берегов реки и ее притоков, находились села и погосты, где до сих пор можно увидеть памятники каменного и деревянного зодчества. В десяти километрах от Рыбинска, на холме у впадения речушки Йоды в Черемуху, расположено село Михайловское. Оттуда, следуя по старому, ныне полузаброшенному тракту на Большое село, можно преодолеть еще около десяти километров проселочной дороги и добраться до села Александрова пустынь. Здесь сохранилась древнейшая постройка Рыбинского района, каменная церковь Троицы, возведенная около 1678 года. Она когда-то была храмом небольшого монастыря, известного еще со времен Ивана Грозного. В XVII веке в монастыре также существовали деревянные церкви Онуфрия Великого и Успения Богоматери с приделом Михаила Архангела, а ансамбль дополняла деревянная шатровая колокольня. В XVIII веке деревянные церкви были разобраны, а в 1764 году монастырь упразднили, превратив каменную церковь в приходской храм.

Троицкая церковь сохранилась до наших дней с большими потерями. Остался только основной объем, высокий четверик, вытянутый по оси север-юг и перекрытый лотковым сводом, на котором установлены три небольших шатра. Изначально храм имел большую трехапсидную алтарную часть и двустолпную трапезную. К северо-западному углу трапезной примыкала шатровая колокольня. В конце XVIII века у северной стены трапезной был построен придел в честь Михаила Архангела, частью которого стал нижний ярус колокольни. В первой половине XIX века к западному фасаду трапезной пристроили паперть; пол храма выложили чугунными плитами, скрывшими древний кирпичный настил.

По своему объемно-композиционному решению Троицкая церковь относится к типу монастырских трапезных церквей, распространенному уже в первой половине XVI века. Трапезная использовалась как место братской трапезы, где собирались все иноки. После закрытия монастыря она стала теплой зимней церковью. Такие церкви были особенно удобны зимой, когда тепло из трапезной обогревало и сам храм. Обычно трапезные церкви строились двухэтажными, чтобы внизу размещались хозяйственные помещения и кухня. Однако бедный лесной монастырь, вероятно, не имел средств для строительства двухэтажного каменного здания.

Внешнее убранство Троицкой церкви отличается суровым лаконизмом, необычным для второй половины XVII века. Фасады оживляют лишь широкие угловые лопатки, узкие окна, напоминающие бойницы, и небольшие квадратные ниши киотов. Три невысоких шатра выглядят несоразмерно малыми по сравнению с основным объемом. Однако раньше, до утраты трапезной, колокольни и алтарных апсид, соотношение частей здания было иным. Прежний облик Троицкой церкви запечатлел в своих рисунках ярославский краевед И.А. Тихомиров, посетивший Александрову пустынь в конце XIX века. Правильное представление об изначальном виде церкви может дать и типологически близкая к ней трехшатровая церковь Владимирской Богоматери в Ярославле.