Церковь, освящённая в честь Иоанна Предтечи, известна в Угличе благодаря драматической истории её создания. Храм Рождества Святого Иоанна был возведён за два года, в 1689-1690 годах, на средства ярославского купца Никифора Григорьевича Чеполосова. Он посвятил его памяти своего шестилетнего сына, трагически погибшего от рук слуги, приказчика Рудака. Этот человек похитил мальчика по дороге к учителю и, ненавидя купца, две недели держал его в плену, пытаясь заставить отречься от отца. Мальчик проявил мужество и не признал похитителя своим отцом, за что был убит. После его смерти произошло несколько чудес: нож выпал из раны только при появлении убийцы, а тело мальчика не подверглось тлению. Родителям Ваня явился во сне, прося не казнить мучителя, и тот был оставлен в живых, но, по преданию, позже "изъеден червями". Храм был посвящён памяти маленького мученика.

В 1960-х годах во время ремонта в северном приделе церкви случайно обнаружили нишу с нетленными мощами Вани Чеполосова. Из-за значимости храма проект строительства гидроэлектростанции в Угличе изменили, чтобы не затопить церковь. ГЭС в итоге построили выше по течению Волги. Церковь была закрыта в 1935 году и использовалась в хозяйственных целях. В 1961-1970 годах её реставрировали по проекту архитектора Семёна Евгеньевича Новикова. Найденные мощи мальчика позже перенесли в Корсунскую церковь, где они находятся и сейчас.

В 2007 году храм был возвращён Русской православной церкви и передан Воскресенскому монастырю. Однако большую часть времени он закрыт, и его можно осматривать только снаружи. Храм представляет большую историческую и художественную ценность. Это классическая пятиглавая церковь с приделами и надвратной колокольней с шатровым завершением, установленная на высоком подклете. Оригинальное крыльцо церкви изображено на картине Николая Рериха 1904 года "Углич. Крыльцо церкви Иоанна Предтечи". Фасады храма, как и в Алексеевском монастыре, украшены красочными изразцами. В 1840 году храм расписывал угличский иконописец Дмитрий Григорьевич Буренин.

Предтеченская церковь поражает своей красотой. Она выглядит великолепно как издалека, так и на фоне белых стен Воскресенского монастыря. При солнечном свете её сверкающие главы и шатры напоминают сказочный дворец, а золотистые стены отражаются в голубой глади Волги.