Первое упоминание о храме Покрова Пресвятой Богородицы в Ростове датируется 1609 годом. В то время он был деревянным, но после крупного пожара купцы города решили восстановить его. Строительство нового каменного храма началось в 1795 году и завершилось в 1803 году. Церковь располагалась на углу Предтеченского переулка и Покровской улицы, отличалась пятью золочеными куполами и красивой колокольней, и считалась одним из самых богатых приходских храмов. В ней были два придела: апостолов Петра и Павла и святого Николая.

В середине XIX века убранство храма было одним из самых богатых в Ростове, а между его прихожанами А.А. Титовым и М.М. Плешановым развернулось настоящее соперничество за право украсить храм. В советское время церковь была закрыта, купола разрушены, иконы переданы в музей, а здание использовалось как склад, а затем как столовая. В 1998 году церковь в плохом состоянии была передана Русской Православной Церкви, и настоятелем стал священник Димитрий Санников.

В храме начались восстановительные работы, и отец Димитрий стал его настоятелем 12 апреля 2006 года. Храм находился в плачевном состоянии, и потребовалось много усилий, чтобы привести его в нынешний вид. Ремонтные работы продолжаются: проведено освещение, отремонтировано отопление, и благодаря попечителям возводится центральный купол.

В храме службы ведутся Знаменным распевом, что позволяет ощутить старорусский дух спокойствия и духовной радости. В апреле 2007 года приход Покровского храма принял решение опекать Православную общеобразовательную школу во имя преподобного Аврамия Ростовского, работающую по принципу домашнего обучения. Школа открыта в 2001 году на Патриаршем Подворье в Аврамиевом Богоявленском монастыре и в 2014 году отметила свое 14-летие. В ней обучается около 35 детей ежегодно, включая детей из семей священнослужителей, многодетных семей и семей с низким уровнем дохода. Изучение Закона Божия, церковнославянского языка и церковного пения дополняет традиционную школьную программу. В школе ценятся сострадание и умение сопереживать, и здесь обучаются дети-инвалиды, дети с особыми образовательными потребностями и дети из приемных семей.