В глубине двора на углу Большой Московской улицы и Рогатицы расположена церковь Святого Климента. Она напоминает храмы последнего столетия независимого Новгорода, хотя была построена в московский период. Архитектурные традиции Новгорода в ней сохранены, что позволяет предположить, что строила её местная артель.

Единственным элементом, указывающим на московское время, является низкий подвал, характерный для той эпохи. Также отмечают, что храм полностью построен из кирпича, что считается признаком московского государства, хотя подобные прецеденты могли бы возникнуть и в Новгороде. Например, церковь Успения на Пирогощей в домонгольском Киеве была построена из кирпича, хотя в основном там использовали известняк, как и в Новгороде.

Согласно Новгородской IV летописи, церковь Святого Климента была возведена в 1519 году по заказу московского купца Василия Тараканова на месте разрушенной одноименной церкви времен новгородской независимости. На противоположной стороне Рогатицы находится загадочная кирпичная руина, известная как дом Марфы Посадницы, оставшаяся после исчезновения рода Таракановых во время опричного погрома 1570 года. Старая церковь, по летописи, "падеся" в 1517 году, и, возможно, была просто обновлена, сохранив основные конструкции. Впервые церковь на этом месте упоминается в Новгородской третьей летописи под 1153 годом, но археологические данные указывают, что город тогда еще не простирался так далеко на север.

С XIV века храм Климента на этом месте существовал и страдал от пожаров. Нынешняя церковь, одна из красивейших построек Торговой стороны Великого Новгорода. В XVII веке к ней пристроили колокольню с островерхой кровлей, подобную звонницам церквей Дмитрия Солунского и Федора Стратилата. В настоящее время церковь Святого Климента не действует, с 1930 года в ней находится склад. В годы войны она сильно пострадала, но сохранила основные формы. В 1950-х годах её восстановили в историческом виде, вновь разместив склад. Позднюю колокольню разобрали на кирпич для восстановления новгородских домов.

В те годы остро стоял вопрос о будущем Новгорода: быть ли ему мертвым городом или возродиться как полноценный центр. Использование кирпича от храмовой звонницы сыграло свою роль в его воссоздании.