Пышминская слобода была основана в середине XVII века. Точная дата основания церкви неизвестна, но историки предполагают, что она появилась вскоре после постройки первых крестьянских изб. Первое упоминание о Пышминском храме относится к 1680 году, и считается, что он был деревянным. Церковь прослужила верующим около ста лет, пока её не разобрали из-за ветхости.

Строительство нового каменного храма началось в 1808 году. Прихожане активно участвовали в закладке первого камня и в основных строительных работах. Храм был двухэтажным и двухпрестольным, выполненным в стиле сибирского барокко. Нижний престол освятили в честь Богоявления Господня в 1820 году, и он был оборудован печами для зимних служб. Верхний этаж считался летним или холодным, и с 1842 года носил имя святого Николая, архиепископа Мир Ликийских, Чудотворца. Через десять лет храм обзавёлся каменной оградой с металлическими решетками. Приход Богоявленской церкви включал жителей Пышмы и соседних деревень, таких как Совиная, Чернышева, Кочевка, Тупицинская, Шипунова, Усть-Дернейская, Кручинина и других.

Особый факт связан с иконой святой великомученицы Параскевы, появившейся в первой половине XIX века. Образ был найден жительницей деревни Совиной (ныне Савино) на реке Пышме. Икону с торжественными молитвами доставили в Богоявленский храм, но вскоре она исчезла и была найдена на том же берегу реки. После нескольких попыток вернуть икону в церковь, её снова находили у реки.

По преданию, одному из местных жителей во сне явилась Пресвятая Богородица и велела не переносить икону, а построить храм на месте её нахождения. Завет был выполнен: сначала в Совиной построили часовню, а затем каменный храм, где икона осталась навсегда.

Храм Богоявления Господня был закрыт большевиками в 1935 году. Церковные ценности изъяли, колокола переплавили, а ограду демонтировали. Здание церкви использовали для нужд рабочего поселка Пышма: там размещались склад, лыжная база, кинотеатр «Колос», а затем музей истории земледелия и крестьянского быта.

В начале 1990-х годов в Пышме была создана православная община. В 1995 году местные власти передали второй этаж Богоявленского храма Русской православной церкви, и с тех пор там проводятся службы. Первый этаж по-прежнему занимает музей, и соседи уживаются без конфликтов. Верующие шутят: «Лучше меньше, чем ничего», ведь престол находится на втором этаже, ближе к Небу.

С каждым годом молитвенное помещение украшается стараниями прихожан и жертвователей. Появляется необходимая утварь и мебель. О полной реконструкции Богоявленского храма говорить пока рано, так как предстоит восстановить нижний придел, колокольню и центральный купол. Когда это произойдет, известно только Богу.