История прихода берет начало в 2000 году, когда игумен Александр (Заркешев), настоятель Свято-Николаевского Собора в Тегеране, начал посещать ОАЭ и проводить регулярные православные богослужения для русскоязычной общины. В мае 2004 года митрополит Смоленский и Калининградский Кирилл на встрече с шейхом Султаном бин Мухаммадом аль-Касеми договорился о выделении участка земли для строительства русского православного храма. Православный приход святого апостола Филиппа был учрежден решением Священного Синода 27 декабря 2005 года.

Закладка храмового комплекса состоялась 9 сентября 2007 года. Строительство велось на средства, пожертвованные Ю. Г. Сидоренко, который стал ктитором храма.

Первое богослужение в церкви прошло на Рождество Христово 7 января 2011 года, а 2 июня на купола были установлены золотые кресты. После установки иконостаса, 13 августа 2011 года состоялось открытие русского православного храма и первое торжественное богослужение.

Храмовый комплекс был построен по проекту архитектора Ю. В. Кирса и включает пятикупольный шатровый храм и трехэтажный культурно-просветительский центр, соединенные крытым переходом со звонницей. В оформлении церкви использованы элементы различных русских архитектурных школ.

Роспись храма и иконостаса выполнена художниками Александром и Екатериной Ивановыми. В куполе храма находится фреска с изображением благословляющего Спасителя. Храмовая икона святого апостола Филиппа была написана супругой ктитора Еленой Сидоренко.

В июне 2012 года начал работу культурно-просветительский центр, где была открыта картинная галерея. Экспозиция включает 23 картины современных украинских и российских художников на евангельские и церковно-исторические темы. Также в центре представлена коллекция художественных голограмм христианских святынь и дарственный буклет «Христианские Святыни», подаренные патриархом в 2010 году.