En 1861, un nouveau prêtre est arrivé à Hakodate, sur l'île de Hokkaido, dans l'église récemment fondée au consulat russe. Pour ses efforts et son activité missionnaire, il a été glorifié comme Nicolas le Japonais, égal aux apôtres.

Ivan Dmitrievitch Kasatkin est né en 1836 dans une famille de clercs près de Smolensk. Pendant ses études au séminaire de Saint-Pétersbourg, il a lu le livre du capitaine Golovnine, décrivant son séjour en captivité au Japon. Ce livre l'a inspiré à prêcher le christianisme sur des îles lointaines. Lors de sa dernière année d'études, il a appris qu'un poste de recteur était vacant dans une église à Hokkaido et a commencé à poursuivre ce poste avec insistance.

En été 1860, il a été ordonné hiéromoine sous le nom de Nicolas, et un an plus tard, il est parti pour le Japon. Les premières années, il a étudié la langue, la culture et les coutumes de la population locale. Le Japon commençait à s'ouvrir au monde après une longue période d'isolement, et la prédication du christianisme était interdite. Le premier converti à l'orthodoxie fut le rônin Takumé Sawabé, qui devint plus tard prêtre sous le nom de Paul.

Le Japon est devenu la seconde patrie du père Nicolas. Jusqu'à sa mort en 1912, il n'a quitté le pays que deux fois pour de courtes périodes. Il a traduit la Sainte Écriture en japonais et a fondé la cathédrale de la Résurrection à Tokyo, connue sous le nom de « Nikolai-do ».

En 1912, il y avait environ 33 000 fidèles orthodoxes au Japon dans 266 communautés. L'autorité et la piété du père Nicolas étaient si grandes que l'empereur Meiji a permis de l'enterrer à Tokyo dans le cimetière municipal, ce qui était une exception à l'époque.

L'évêque Nicolas (Ivan Kasatkin) a été canonisé le 10 avril 1970.