Le monastère a été fondé par des moines byzantins vénérateurs des icônes au plus tard au VIIIe siècle. En 754, des persécutions contre les icônes ont commencé dans l'Empire byzantin, et la prière devant elles est devenue considérée comme de l'idolâtrie. Selon la légende, le moine Michel a décidé de sauver une icône en l'emportant du monastère. Il est parti en voyage pour trouver un nouveau refuge. Dans ses recherches, Michel est arrivé en Crimée, où la Vierge Marie lui est apparue en rêve et lui a dit que les persécutions prendraient bientôt fin, et qu'il devait s'installer dans l'une des grottes de la vallée, où un grand monastère serait ensuite construit. La prophétie, dit-on, s'est réalisée : en 780, la lutte contre les icônes a pris fin, et la grotte avec Michel s'est transformée en un grand monastère.

En 1475, l'Empire ottoman a conquis la ville de Choufout-Kale, détruisant la moitié de sa population et fondant la nouvelle ville de Bakhchisarai. Tout cela se passait à 2-3 km du monastère. Pendant les combats et la construction de Bakhchisarai, le monastère de l'Assomption a non seulement survécu, mais est devenu le centre du christianisme en Crimée. Il existe de nombreuses légendes selon lesquelles les khans de Crimée venaient au monastère devant des événements importants pour demander de l'aide à la sainte icône.

De nouvelles périodes difficiles pour le temple ont commencé en 1778, lorsque les khans de Crimée ont commencé à persécuter les chrétiens et leur foi. La majeure partie de la population orthodoxe s'est déplacée vers les rives de la mer d'Azov, où de nombreux villages et la future ville de Marioupol ont été fondés. Le khan de Crimée ne s'est pas limité aux purges sur la péninsule et a mené des raids sur le territoire de l'Empire russe, ce qui a conduit à une guerre avec la Russie. En 1783, la péninsule de Crimée est passée sous le contrôle de l'Empire russe, et le monastère de l'Assomption est redevenu un lieu d'attraction pour les paroissiens et les croyants de toute la Russie.

Des temps difficiles sont arrivés après la révolution de 1917, lorsque le temple a été fermé et pillé. La restauration a commencé en 1993, lorsque le territoire du temple a été transféré au patriarcat de Crimée, et de longues années de restauration des anciennes reliques ont commencé.

Aujourd'hui, le monastère de l'Assomption est ouvert à tous. La visite est strictement autorisée selon les canons de l'église : les hommes ne peuvent pas entrer en shorts, et les femmes doivent porter des jupes et avoir la tête couverte.