Le musée a été ouvert au public en 1973 grâce à l'initiative de Maxim Alexeïevitch Choubenkov et se trouvait initialement dans un petit bâtiment en bois. En 1980, il a été transféré dans des locaux au deuxième étage de l'ancien bâtiment de la banque d'État. À la demande de l'administration municipale, conformément à la décision du Conseil des ministres de la BASSR du 23 juin 1989, le musée de Touïmazy est devenu une filiale du Musée unifié de Bachkirie, qui est maintenant connu sous le nom de Musée national de la République de Bachkortostan. Lilia Nykmouhametovna Kadyrova a été nommée directrice, dirigeant le musée pendant 18 ans.

Au départ, le nombre d'expositions était limité, et des matériaux étaient nécessaires pour créer les premières expositions. Les deux premières salles ont ouvert le 23 février 1990. Au fil des ans, le musée s'est établi comme une institution unique, rassemblant des objets rares et intéressants.

Les visites et conférences menées par les chercheurs du musée sont constamment demandées dans les établissements d'enseignement de la ville et de la région. Les visiteurs d'autres villes sont attirés par l'intimité et la vivacité des expositions. Les enfants d'âge préscolaire et les élèves s'intéressent particulièrement à la salle « Monde végétal et animal de la RB », tandis que les générations plus âgées apprécient la possibilité de voir l'histoire de leur région à travers des visages et des événements. Personne ne reste indifférent après avoir visité la salle « Culture matérielle des peuples de la RB ». Les habitants de Touïmazy et les invités de la ville visitent avec plaisir les expositions d'art organisées par le musée.