Fondé au XIIIe siècle sur le chemin du Kremlin de Souzdal à Kideksha, le monastère Vassili était à l'origine une puissante forteresse, transformée plus tard en monastère. Selon la légende, cet endroit est lié au prince Vladimir le Soleil Rouge, qui, lors de son baptême, a pris le nom de Vassili. On pense que les Souzdaliens ont adopté le christianisme dans l'église qui se trouvait auparavant sur le territoire de l'actuel monastère Vassili.

La cathédrale de Vassili le Grand a été construite entre 1662 et 1669 à l'emplacement d'une ancienne église en bois. Son architecture se caractérise par sa simplicité : la forme cubique est surmontée d'un dôme sur une prisme octogonale. Sous le toit, les bases de deux autres tambours ont été conservées, ce qui indique l'intention initiale de la rendre à trois dômes. La décoration de la cathédrale est également simple, avec les éléments les plus raffinés sous forme de portails d'entrée. Une petite salle à manger relie la cathédrale à un clocher à trois niveaux du XIXe siècle, orné de pilastres et de corniches sculptées. L'église de la rencontre à dôme unique, construite à la fin du XVIIe siècle, a un toit à huit pentes, rappelant l'église des palais épiscopaux dans le Kremlin de Souzdal.

En 1764, le monastère Vassili a été classé parmi les monastères hors statut. Jusqu'en 1899, il était rattaché au monastère de Rizopolozhensky, et jusqu'en 1916, au monastère de Spaso-Euphémie.

Depuis 1916, le monastère a fonctionné comme un monastère féminin, mais a été fermé par le pouvoir soviétique le 15 février 1923.

La cathédrale Vassili a été restaurée entre 1959 et 1961 sous la direction de V. V. Gasperovitch. Depuis les années 1960, des entrepôts ont été installés sur le territoire du monastère.

Le 31 janvier 1995, la communauté masculine du monastère Vassili a été à nouveau enregistrée, et le 6 juin de la même année, le Saint-Synode de l'Église orthodoxe russe a béni son ouverture.