Fundado en el siglo XIII en el camino del Kremlin de Suzdal a Kideksha, el monasterio de Basilio era originalmente una poderosa fortaleza, que luego se transformó en monasterio. Según la leyenda, este lugar está relacionado con el príncipe Vladimir el Sol Rojo, quien al ser bautizado tomó el nombre de Basilio. Se considera que los suzdalianos aceptaron el cristianismo en la iglesia que anteriormente se encontraba en el territorio del actual monasterio de Basilio.

La catedral de San Basilio el Grande fue construida entre 1662 y 1669 en el lugar de una antigua iglesia de madera. Su arquitectura se caracteriza por la simplicidad: la forma cúbica está coronada por una cúpula sobre un prisma octogonal. Bajo el techo se han conservado las bases de otros dos tambores, lo que indica la intención original de hacerla de tres cúpulas. La decoración de la catedral también es simple, con los elementos más elaborados en forma de portales de entrada. Un pequeño refectorio conecta la catedral con el campanario de tres niveles del siglo XIX, adornado con pilastras y cornisas talladas. La iglesia refectorio de la Presentación, de una cúpula, construida a finales del siglo XVII, tiene un techo a ocho aguas, que recuerda a la iglesia de las Cámaras Arzobispales en el Kremlin de Suzdal.

En 1764, el monasterio de Basilio fue trasladado a la categoría de monasterios sin estado. Hasta 1899 estuvo adscrito al monasterio de Rizopolozhensky, y hasta 1916, al monasterio de Spaso-Evfimiev.

Desde 1916, el monasterio funcionó como femenino, pero fue cerrado por el poder soviético el 15 de febrero de 1923.

La catedral de Basilio fue restaurada entre 1959 y 1961 bajo la dirección de V. V. Gasperovich. Desde la década de 1960, en el territorio del monasterio se ubicaron almacenes.

El 31 de enero de 1995 se registró nuevamente la comunidad masculina del monasterio de Basilio, y el 6 de junio del mismo año, el Santo Sínodo de la Iglesia Ortodoxa Rusa bendijo su apertura.