Le monastère féminin de la Sainte-Trinité a été fondé en 1643 par un riche marchand de Mourom, Taras Borisov, connu sous le nom de Bogdan Tsvetnoy, à l'emplacement d'une église en bois. Selon la légende, ici, sur la "Vieille colline de Vyshny", le prince Constantin, qui a baptisé la terre de Mourom, a construit la première église en bois en l'honneur de Boris et Gleb. Plus tard, une église en bois de la Trinité a été érigée à cet endroit. Dans une description de 1636, il est mentionné qu'elle se trouvait en face du monastère de l'Annonciation et qu'elle était en bois avec un toit en forme de tente, avec une tête en fer et une croix. L'église avait une chapelle dédiée à Boris et Gleb, ainsi que des vases sacrés et des ornements, tous construits par le marchand de Mourom Boris Semyonov et son fils Bogdan. En 1642, la construction d'une église en pierre a commencé à l'emplacement de l'ancienne église en bois, et un an plus tard, la cathédrale au nom de la Sainte-Trinité a été érigée. La pierre de fondation, qui a été conservée jusqu'à nos jours, témoigne de l'achèvement de la construction en août 1642 grâce aux efforts de Taras Borisov.

En 1643, Bogdan Tsvetnoy a obtenu la permission de l'Évêque de Riazan et de Mourom pour créer un monastère féminin à l'emplacement de la paroisse de la Trinité. En 1648, une église au nom de l'icône de Kazan de la Mère de Dieu a été construite au-dessus des Portes Saintes. En 1652, la construction d'un clocher à plusieurs niveaux a été achevée, ce qui a définitivement formé l'apparence architecturale du monastère. La principale relique est devenue la Croix de Vilnius, associée au nom de Bogdan Tsvetnov.

En 1663, le monastère a reçu un décret du tsar Alexeï Mikhaïlovitch, l'exemptant d'impôts. En 1764, 15 moniales vivaient dans le monastère, et des moniales ont été transférées ici depuis des monastères supprimés. En 1786, le porche et la galerie de la cathédrale ont été reconstruits pour agrandir le bâtiment. En 1792, un incendie a détruit toutes les cellules, et en 1805, la clôture en bois a brûlé. En 1807, grâce aux fonds de la veuve Alexandra Dmitrievna Neymanova, la construction d'une nouvelle clôture en pierre a commencé, achevée en 1808. En 1810, la chapelle des Trois Saints de la cathédrale a été reconstruite. En 1865, grâce aux fonds d'Alexeï Vassilievitch Ermakov, une chapelle en pierre a été construite, et les dômes de la cathédrale et du clocher ont été dorés. En 1885, la construction d'un deuxième étage au-dessus de la chapelle chaude a été autorisée. En 1898, un bâtiment en pierre a été construit, où en 1899, une école paroissiale pour filles a ouvert, devenant à deux classes en 1902.

En 1918, le monastère a été fermé, et ses bâtiments ont été utilisés à diverses fins. Dans les années 1930, le monastère était sous la direction du ministère de la Défense, et ses bâtiments étaient utilisés comme entrepôts. En 1941, le bâtiment de la cathédrale a été transféré à un atelier de cordonnerie. En 1961-1962, une restauration cosmétique a été réalisée. Dans les années 1970, l'ensemble du monastère a été reconnu monument d'importance républicaine. Le 15 mai 1991, le monastère a été transféré à l'Église orthodoxe russe, devenant le premier monastère féminin ouvert dans l'éparchie de Vladimir.

Depuis 2001, un foyer "Nadejda" pour mineurs et personnes âgées fonctionne au monastère. Le monastère soutient également plusieurs prisons, une colonie pour mineurs, une unité militaire et la société des invalides en fauteuil roulant de Mourom, "Phoenix".