La restauration du monastère a commencé dans les années 1990. Les clercs et les fidèles des églises de la région des Eaux Minérales du Caucase, ainsi que des représentants du cosaquisme, ont activement participé au déblaiement du terrain et à la construction de l'église Saint-Georges. Cette église a été consacrée le 28 août 2001 par le métropolite de Stavropol et de Vladikavkaz, Gédéon, marquant le début d'une nouvelle ère dans l'histoire du monastère de Vtoroafon.

Depuis avril 2014, la construction d'une majestueuse cathédrale principale de la communauté dans le style byzantin, dédiée à l'Assomption de la Sainte Vierge, est en cours. La superficie de la cathédrale est de 500 mètres carrés. Les murs de l'église sont revêtus de pierre coquillière et de tuf terracotta, et leur hauteur atteint 28 mètres.