La cathédrale de la Transfiguration du Sauveur était le principal temple de l'éparchie de Perm aux XIXe et début XXe siècles. Son histoire commence au XVIe siècle, lorsque, en 1560, Anika Stroganov fonde le monastère de Pyskorsky sur la Kama. Ce monastère était l'un des plus riches de l'Oural grâce au soutien des célèbres industriels Stroganov. Cependant, à la moitié du XVIIIe siècle, le monastère s'est appauvri. Avec la création du gouvernement de Perm, l'impératrice Catherine II ordonna le transfert du monastère à Perm, ce qui lui donna une seconde vie. À ce nouvel emplacement, la construction des cellules monastiques et de l'église de Stéphane, consacrée en 1798, a commencé. Le projet de la cathédrale a été élaboré à Moscou, probablement par M. F. Kazakov ou ses élèves, et finalisé par l'architecte permien G. Kh. Paulsen.

La cathédrale de la Transfiguration du Sauveur ressemble à celle de Christ-Rédempteur à Lipetsk, peut-être en raison d'un projet type. Elle devait devenir le bâtiment central de l'ensemble monastique, comprenant la maison de l'archevêque, le séminaire théologique et d'autres constructions. La préparation et le financement de la construction de la cathédrale ont duré près de 10 ans, de 1789 à 1798. Les fondations ont été posées en 1798, et la construction s'est faite par étapes. La partie estivale du temple, l'église de la Transfiguration du Seigneur, a été achevée en 1818 et consacrée en 1819. Ensuite, la construction d'un clocher de 67 mètres a commencé, selon les plans des architectes P. T. Vassiliev et P. I. Tamansky, sur lequel ont été installées 11 cloches provenant du monastère de Pyskorsky.

La grande consécration de la cathédrale a eu lieu en 1832 par l'évêque de Perm, Arcadi. Pour décorer la cathédrale, un iconostase sculpté a été transféré du monastère de Pyskorsky, réalisé à Ekaterinbourg et à Moscou. Le style architectural de la cathédrale est de type néoclassique, avec des éléments de l'architecture uralienne : murs épais en brique, grilles métalliques et portes en fonte.

La construction de la cathédrale a été soutenue par les habitants de la province de Perm, qui ont fait des dons d'argent et de matériaux. La cathédrale a été plusieurs fois rénovée. En 1853-1854, selon le projet de G. P. Letuchy, la première reconstruction a été réalisée, reliant le clocher et la cathédrale par une galerie. En 1892-1893, A. B. Turchievich a ajouté deux chapelles avec des coupoles en oignon.

En 1931, la cathédrale a été fermée aux services religieux et transformée en galerie d'art. De 1954 à 1958, le bâtiment a été rénové, devenant un bâtiment de trois étages. Le projet d'extension a été réalisé par N. A. Shvarev. À l'intérieur, des salles de cours et des bureaux ont été aménagés, le chauffage et l'électricité ont été installés. L'apparence de la cathédrale a changé : des arbres ont poussé sur le clocher, et en 1946, il a été endommagé par des feux d'artifice, mais a été restauré.

En 1996, des discussions ont commencé sur le transfert de la cathédrale à l'éparchie de Perm. Cela s'est officiellement produit en 2011, et en 2012, le bâtiment a été restitué à l'Église. L'éparchie de Perm a commencé à préparer la rénovation pour redonner à la cathédrale son apparence historique. En 2011, le démontage de l'ancienne coupole, usée à 95 %, a commencé. La nouvelle coupole est faite de matériaux modernes et recouverte d'un revêtement en nitrure de titane. La restauration extérieure de la façade touche à sa fin, des croix ont été installées, la toiture et les fenêtres ont été remplacées. La restauration intérieure commencera après le déménagement de la galerie, et la restauration de l'iconostase unique du XVIIIe siècle est à prévoir.

À côté de la cathédrale, le temple de saint Mitrophane de Voronej et l'église domestique de la résidence des archevêques ont été restaurés. Dans ce centre historique de Perm se trouvait un nécropole où des personnes célèbres ont été enterrées, mais dans les années 1930, le cimetière a été fermé et transformé en zoo. La cathédrale de la Transfiguration du Sauveur reste un symbole spirituel et architectural important de Perm, son clocher de 67 mètres étant l'un des éléments emblématiques de la ville. La cathédrale redeviendra un centre spirituel pour Perm et la région de Perm.