Le musée historique et local de Primorsko-Akhtarsk a commencé son histoire en tant que musée public. Sa création a été proposée en 1959 par des enseignants-historiens lors d'une réunion de la section « Histoire » du département de l'éducation populaire du district. À ce moment-là, chacun des participants avait déjà rassemblé un vaste matériel local sur l'histoire du district de Primorsko-Akhtarsk. L'idée a été soutenue par le département de la culture et le comité exécutif du district, et le 6 juin 1960, le Conseil des députés travailleurs de Primorsko-Akhtarsk a pris la décision de créer un musée historique et local de district sur une base publique.

Au départ, le musée était situé dans la Maison des pionniers. Son ouverture a eu lieu le 19 mai 1962 et a été coïncidée avec le 40e anniversaire de l'organisation des pionniers nommée d'après V.I. Lénine. Le premier directeur était l'un des organisateurs, Piotr Kouzmitch Pichouguine.

Au début, le musée occupait une, puis deux salles dans la Maison des pionniers. La collection du musée se formait à partir des matériaux rassemblés par les fondateurs, incluant des découvertes archéologiques, des objets de paléontologie et des expositions liées au passé pré-révolutionnaire, à la guerre civile et à la Grande Guerre patriotique.

Progressivement, le nombre d'expositions augmentait grâce aux découvertes des habitants locaux, des élèves et des pêcheurs. Au milieu des années 1970, le musée s'est agrandi et a déménagé dans un ancien bâtiment, auparavant propriété du marchand V.V. Malyshev. Pendant un certain temps, le musée était sous la direction du kolkhoze de culture de champs nommé d'après V.I. Lénine. Le 23 décembre 1980, le musée a reçu le titre de « Musée populaire » par un ordre du ministre de la culture de la RSFSR. Actuellement, la collection compte 6431 objets.

La collection paléontologique comprend divers échantillons, parmi lesquels se distinguent les os de géants animaux ayant vécu sur le territoire du district il y a des millions d'années. Les os d'un éléphant du sud ont été découverts en 1953 sur la côte de la mer d'Azov. Bien que beaucoup d'entre eux aient été détruits, grâce à l'infirmier I.I. Pleteshkov, les fragments conservés ont été envoyés au musée. Dans les années 1970, un fragment de défense a été trouvé sur la côte de Yasenka.

La collection archéologique du musée contient des expositions uniques, telles qu'une amphore byzantine des VIe et VIIe siècles avec une croix chrétienne. Il y a aussi une urne à deux mains des XVIIe et XVIIIe siècles, trouvée par des pêcheurs dans le détroit de Kertch en 1979.

Parmi d'autres expositions intéressantes, un récipient à deux mains avec incrustation et une tablette en argile avec des inscriptions, trouvée en 1991. La tablette, supposément, appartient à l'époque moderne et nécessite une attribution supplémentaire.

Un autre objet significatif, une sculpture en pierre médiévale, a été trouvée dans les années 1970 par des élèves de l'école n° 8. La sculpture nécessite des études supplémentaires et pourrait appartenir à l'époque polovtsienne ou à une période antérieure.

La collection du musée est constamment enrichie et comprend des objets de paléontologie, d'archéologie, de minéralogie, de la vie cosaque, ainsi que des expositions liées aux guerres du Caucase, à la guerre civile et à la Grande Guerre patriotique et à la période soviétique.

Depuis 2002, le musée a obtenu le statut d'établissement culturel municipal, et depuis 2013, le statut d'établissement culturel autonome municipal.