El Museo Histórico y Local de Primorsko-Ajtarsk comenzó su historia como un museo público. Su creación fue propuesta en 1959 por maestros historiadores en una reunión de la sección "Historia" del departamento de educación pública del distrito. Para entonces, cada uno de los participantes ya había recopilado un extenso material local sobre la historia del distrito de Primorsko-Ajtarsk. La idea fue apoyada por el departamento de cultura y el consejo ejecutivo del distrito, y el 6 de junio de 1960, el Consejo de Diputados de Trabajadores de Primorsko-Ajtarsk tomó la decisión de crear un museo histórico y local del distrito de manera pública.

Inicialmente, el museo se ubicaba en la Casa de los Pioneros. Su apertura tuvo lugar el 19 de mayo de 1962 y se celebró en conmemoración del 40 aniversario de la organización de pioneros nombrada en honor a V.I. Lenin. El primer director fue uno de los organizadores, Piotr Kuzmich Pichugin.

Al principio, el museo ocupaba una, y luego dos habitaciones en la Casa de los Pioneros. La colección del museo se formó a partir de los materiales recopilados por los fundadores, que incluyen hallazgos arqueológicos, objetos de paleontología y exposiciones relacionadas con el pasado prerrevolucionario, la Guerra Civil y la Gran Guerra Patria.

Poco a poco, la cantidad de exposiciones aumentó gracias a los hallazgos de los habitantes locales, estudiantes y pescadores. A mediados de la década de 1970, el museo se expandió y se trasladó a un antiguo edificio que anteriormente pertenecía al comerciante V.V. Malyshev. Durante un tiempo, el museo estuvo bajo la administración del koljós de cultivo de campo nombrado en honor a V.I. Lenin. El 23 de diciembre de 1980, el museo recibió el título de "Museo del Pueblo" por orden del ministro de cultura de la RSFSR. Actualmente, la colección cuenta con 6431 objetos.

La colección paleontológica incluye una variedad de muestras, entre las que destacan los huesos de gigantescos animales que habitaron el área hace millones de años. Los huesos de un elefante del sur fueron descubiertos en 1953 en la costa del mar de Azov. Aunque muchos de ellos fueron destruidos, gracias al paramédico I.I. Pleteshkov, los fragmentos que se conservaron llegaron al museo. En la década de 1970, se encontró un fragmento de colmillo en la costa de Yasenskaya.

La colección arqueológica del museo contiene exposiciones únicas, como una ánfora bizantina de los siglos VI y VII con una cruz cristiana. También hay una urna de dos manos de los siglos XVII y XVIII, encontrada por pescadores en el estrecho de Kerch en 1979.

Entre otras exposiciones interesantes, hay un recipiente de dos manos con incrustaciones y una tablilla de arcilla con inscripciones, encontrada en 1991. La tablilla, presumiblemente, pertenece a tiempos modernos y necesita una mayor atribución.

Otro objeto significativo es una escultura de piedra medieval, encontrada en la década de 1970 por alumnos de la escuela Nº 8. La escultura requiere un estudio adicional y, posiblemente, pertenece a la época polovtsiana o a un período anterior.

La colección del museo se está ampliando constantemente e incluye objetos de paleontología, arqueología, mineralogía, vida cosaca, así como exposiciones relacionadas con las guerras del Cáucaso, la Guerra Civil y la Gran Guerra Patria, y el período soviético.

Desde 2002, el museo ha obtenido el estatus de institución cultural municipal, y desde 2013, el estatus de institución cultural autónoma municipal.