La collection a été créée en 1789 au sein de l'usine Nikolaï-Bakhmetev et représentait à l'origine une salle d'échantillons. En 1914, elle était déjà mentionnée dans des documents comme musée. Trois générations de la famille Bakhmetev et le prince Alexandre Dmitrievitch Obolensky ont rassemblé des échantillons des produits de leur usine, ainsi que des œuvres en verre bohémien, français, anglais et polonais.

Après la nationalisation de l'usine et son renommage en "Géant Rouge" en 1923, la collection du musée a continué à s'enrichir grâce aux efforts des directeurs de l'usine. Ces dernières années, le fonds s'est élargi grâce à des dons de particuliers et aux œuvres d'artistes du verre, qui sont transférées au musée après des symposiums organisés à Nikolaï depuis 2006. La collection du musée du verre et du cristal de Nikolaï est considérée comme l'une des plus uniques et des plus grandes en Russie et est reconnue par les historiens de l'art comme la meilleure du pays.

L'exposition permanente, située au deuxième étage du bâtiment, est présentée dans un ordre chronologique et comprend environ 5 000 objets, ce qui permet de donner une idée complète de la collection du musée. On y trouve des œuvres de l'usine Nikolaï-Bakhmetev des XVIIIe et XIXe siècles, ainsi qu'une sélection de périodes plus récentes. L'exposition comprend également une petite partie de la collection de verre d'Europe de l'Ouest, de la porcelaine des usines européennes et russes, ainsi que des objets offerts au musée par diverses personnes.

Au premier étage du musée, des expositions temporaires ont lieu, présentant les œuvres d'artistes et d'artisans de la fin du XXe et du début du XXIe siècle, y compris les produits des usines modernes de Nikolaï et du verre décoratif contemporain, offert par les auteurs après la fin des symposiums internationaux.