L'établissement a commencé ses activités dans les années 1920 en tant que Musée de la nature locale nommé d'après Herzen. Au cours de presque un siècle d'histoire, l'exposition a changé de nom à plusieurs reprises, mais ses fonctions principales sont restées inchangées : la collecte, l'étude et la vulgarisation des connaissances sur la nature de la région de Vologda, ainsi que l'observation des changements de la faune et de la flore après la création du réservoir de Rybinsk.

Aujourd'hui, le Musée de la nature est fier de sa riche collection de minéraux, de roches et de fossiles. Sa superficie totale est de 500 mètres carrés. En plus des salles d'exposition, il y a une petite salle pour des cours et des leçons, destinée aux élèves et aux étudiants. Le musée propose deux expositions permanentes : « Motifs forestiers » et « Voyage dans le monde des fossiles ». La première exposition est consacrée aux richesses naturelles de Tcherepovets et de ses environs, ainsi qu'au développement de la flore et de la faune locales.

La collection du musée compte environ 30 000 objets exposés dans le cadre de diverses expositions. Les fossiles anciens sont présentés dans la section « Voyage dans le monde des fossiles ». La formation des fonds de cette exposition a commencé en 1907, lorsque des restes d'animaux disparus ont été découverts lors de la construction d'un quai sur la rivière Yagorba. Dans les années 1940-1970, la collection a été activement enrichie lors de la construction d'un complexe métallurgique. De nombreux os de mammouths ont été trouvés dans des carrières et des fouilles de construction à proximité. Les employés du musée continuent de mener des expéditions, enrichissant les fonds avec de nouveaux matériaux précieux.

Une grande section est dédiée à la collection de photographies reflétant la beauté de la nature russe. On y trouve des œuvres de photographes célèbres tels que V. N. Mikhaïlov, M. V. Berezovski et N. D. Shkurupadski.