Die Einrichtung begann ihre Tätigkeit bereits in den 1920er Jahren als Museum der lokalen Natur nach Herzen. In fast einem Jahrhundert wechselte die Ausstellung mehrfach ihren Namen, aber ihre Hauptfunktionen blieben unverändert: Sammlung, Untersuchung und Popularisierung von Wissen über die Natur der Region Wologda sowie Beobachtung der Veränderungen in der Fauna und Flora nach der Schaffung des Rybinsker Stausees.

Heute ist das Naturmuseum stolz auf eine reiche Sammlung von Mineralien, Gesteinen und Fossilien. Die Gesamtfläche beträgt 500 Quadratmeter. Neben den Ausstellungsräumen gibt es einen kleinen Raum für Unterricht und Lektionen, der für Schüler und Studenten gedacht ist. Im Museum gibt es zwei ständige Ausstellungen: "Waldmotive" und "Reise in die Welt der Fossilien". Die erste Ausstellung widmet sich den natürlichen Reichtümern von Tscherepowez und seiner Umgebung sowie der Entwicklung der lokalen Flora und Fauna.

Die Sammlung des Museums umfasst etwa 30.000 Exponate, die im Rahmen verschiedener Ausstellungen präsentiert werden. Antike Fossilien sind im Abschnitt "Reise in die Welt der Fossilien" zu finden. Die Bildung der Bestände dieser Ausstellung begann bereits 1907, als beim Bau eines Anlegers am Fluss Jagorba Überreste ausgestorbener Tiere entdeckt wurden. In den 1940er bis 1970er Jahren wurde die Sammlung während des Baus des Metallurgischen Kombinats aktiv erweitert. Viele Mammutknochen wurden in nahegelegenen Steinbrüchen und Baugruben gefunden. Die Mitarbeiter des Museums führen weiterhin Expeditionen durch und bereichern die Bestände mit neuen wertvollen Materialien.

Ein eigener großer Abschnitt ist der Sammlung von Fotografien gewidmet, die die Schönheit der russischen Natur widerspiegeln. Hier sind Arbeiten bekannter Fotografen wie W. N. Michailow, M. W. Beresowski und N. D. Schkuropadski aufbewahrt.