Le 9 juillet 1932, le Présidium de l'Exécutif régional de l'Oural a décidé de créer un musée régional dans le nouvel arrondissement national Ostyako-Vogul, dans la ville d'Ostyako-Vogulsk (aujourd'hui Khanty-Mansiysk). Il a été décidé de fournir des expositions et des matériaux du musée de Tobolsk, en lien avec la nouvelle institution, dans le cadre d'un plan de développement économique et culturel.

Le 1er juillet 1934, Ivan Andreyevich Shabalin a été nommé chercheur en charge de l'organisation du musée. Le 15 octobre 1934, un décret a été émis pour le déploiement des activités du musée régional, soulignant son importance scientifique et politique.

À la fin de 1935, le musée a reçu des locaux, un ancien baraquement de la société de pêche sur la rue Komsomolskaya, 9, où une bibliothèque pour enfants a également été installée. Bien que les locaux soient sombres et humides, le musée a ouvert ses portes aux visiteurs le 4 novembre 1936. L'exposition comprenait huit sections, reflétant l'histoire politique, les richesses naturelles et l'économie de l'arrondissement, ainsi que la vie des peuples khanty et mansi.

L'exposition était principalement composée d'objets de l'exposition anniversaire consacrée au cinquième anniversaire de l'arrondissement. Les objets sont arrivés au musée par divers moyens : ils ont été achetés, donnés ou transférés depuis les bureaux de l'administration régionale du NKVD et du comité exécutif du district de Berezovsky après l'insurrection de Kazym et les répressions de 1937.

Ivan Andreyevich Shabalin, fondateur et premier directeur du musée, a été démis de ses fonctions le 20 février 1936, arrêté le 8 juillet 1937 et exécuté le 12 août 1937 à Tobolsk. Il a été réhabilité le 6 juin 1989.

De 1934 à 1952, le musée a été dirigé par des passionnés : I. A. Shabalin, V. S. Denisienko, S. P. Lifshits, M. A. Kamkova, M. A. Voskoboynikov, P. G. Ivanitsky, V. P. Gavrin.

La prochaine étape de l'histoire du musée est liée à Yulia Sergeyevna Lipchinskaya et Arkadiy Nikolaevich Loskutov, qui ont dirigé le musée de 1952 à 1981. À la fin des années 1950 et au début des années 1960, le musée a cherché à retrouver son statut d'institution scientifique. En 1955, des chercheurs ont été recrutés, ce qui a permis d'activer le travail d'exposition et d'organiser des expéditions. En 1956, une expédition complète a été réalisée pour étudier les conditions naturelles et la culture des khanty.

Le 1er février 1960, le musée a été fermé pour rénovation. Au cours de l'année, un nouveau bâtiment a été construit, qui a ouvert ses portes aux visiteurs en 1962. Arkadiy Nikolaevich Loskutov, devenu directeur en 1964, a élargi le travail éducatif du musée, organisé des sorties pour le personnel et un musée itinérant sur un bateau.

De 1981 à 1986, la construction d'un nouveau bâtiment du musée a été réalisée, et de 1986 à 1991, une nouvelle exposition a été créée. Le 1er décembre 1991, elle a été ouverte aux visiteurs, présentant les richesses naturelles et la culture des peuples de l'arrondissement.

La dernière étape de l'histoire du musée a commencé par sa transformation en "Musée de la Nature et de l'Homme". Cela a conduit à une rénovation et à un nouveau niveau de développement. Le musée est devenu l'un des plus modernes en Russie, avec des expositions uniques et des fonds vastes.

Pour son 80e anniversaire, le Musée de la Nature et de l'Homme s'est présenté sous un nouveau jour, continuant sa mission d'étude et de préservation du patrimoine de l'Autonomie khanty-mansi, de l'Yougra.