El 9 de julio de 1932, el Presidium del Comité Ejecutivo del Óblast de los Urales decidió crear un museo regional en el recién formado distrito nacional de Ostyako-Vogul, en la ciudad de Ostyako-Vogulsk (hoy Janty-Mansiysk). Se decidió asignar exposiciones y materiales del museo de Tobolsk que tuvieran relación con la nueva institución, en el marco de un plan para el desarrollo económico y cultural.

El 1 de julio de 1934, Ivan Andreyevich Shabalin fue nombrado investigador encargado de la organización del museo. El 15 de octubre de 1934 se emitió un decreto sobre el desarrollo del trabajo del museo regional, subrayando su importante significado científico y político.

A finales de 1935, se proporcionó al museo un local, un viejo barracón del sindicato de pescadores en la calle Komsomolskaya, 9, donde también se ubicó una biblioteca infantil. Aunque el local era oscuro y húmedo, el 4 de noviembre de 1936 el museo abrió sus puertas al público. La exposición incluía ocho secciones que reflejaban la historia política, las riquezas naturales y la economía del distrito, así como la vida de los pueblos janty y mansi.

La base de la exposición consistió en los objetos de la exposición conmemorativa dedicada al quinto aniversario del distrito. Las exposiciones llegaron al museo de diversas maneras: se compraron, se recibieron como donaciones o se transfirieron desde las oficinas del departamento regional del NKVD y del Comité Ejecutivo del distrito de Berezovsky después de la revuelta de Kazym y las represiones de 1937.

Ivan Andreyevich Shabalin, fundador y primer director del museo, fue destituido de su cargo el 20 de febrero de 1936, arrestado el 8 de julio de 1937 y fusilado el 12 de agosto de 1937 en Tobolsk. Fue rehabilitado el 6 de junio de 1989.

Desde 1934 hasta 1952, el museo fue dirigido por entusiastas de su labor: I. A. Shabalin, V. S. Deniseko, S. P. Lifshits, M. A. Kamkova, M. A. Voskoboynikov, P. G. Ivanitsky, V. P. Gavrin.

La siguiente etapa en la historia del museo está relacionada con Yulia Sergeyevna Lipchinskaya y Arkadiy Nikolaevich Loskutov, quienes dirigieron el museo de 1952 a 1981. A finales de los años 50 y principios de los 60, el museo buscó recuperar su estatus de institución científica. En 1955, se contrataron investigadores, lo que permitió activar el trabajo de exposiciones y organizar expediciones. En 1956, se llevó a cabo una expedición integral para estudiar las condiciones naturales y la cultura de los janty.

El 1 de febrero de 1960, el museo fue cerrado para su reconstrucción. Durante un año se construyó un nuevo edificio, que se inauguró para los visitantes en 1962. Arkadiy Nikolaevich Loskutov, al convertirse en director en 1964, amplió el trabajo educativo del museo, organizó salidas de empleados y un museo móvil en un barco de pasajeros.

De 1981 a 1986 se construyó un nuevo edificio del museo, y de 1986 a 1991 se creó una nueva exposición. El 1 de diciembre de 1991, fue abierta al público, presentando las riquezas naturales y la cultura de los pueblos del distrito.

La última etapa en la historia del museo comenzó con su transformación en el "Museo de la Naturaleza y el Hombre". Esto llevó a una reconstrucción y al logro de un nuevo nivel de desarrollo. El museo se convirtió en uno de los más modernos de Rusia, con exposiciones únicas y amplios fondos.

Con motivo de su 80 aniversario, el Museo de la Naturaleza y el Hombre se presentó renovado y equipado, continuando su misión de estudiar y preservar el legado del Distrito Autónomo de Janty-Mansi, Yugra.