En 1961, Viktor Petrovitch Ershov, enseignant de géographie à l'école internat n° 4 de Medvejegorsk, a organisé avec ses élèves des excursions locales dans les environs. À la suite de ces excursions, de nombreuses découvertes ont été rassemblées, devenant les premiers objets exposés du musée scolaire. Le 7 avril 1962, sur la base de cette école-internat, le musée historique et local de Medvejegorsk a été ouvert, portant initialement ce nom.

Au cours de sa première année d'activité, le musée a accueilli plus de mille visiteurs. Viktor Petrovitch Ershov est devenu le directeur du musée, continuant avec ses élèves à organiser des excursions et à rassembler de nouveaux objets pour la collection.

En 1969, par décision du Conseil des ministres de la République socialiste soviétique autonome de Carélie, le musée scolaire a été transformé en une branche du musée d'histoire, d'architecture et d'ethnographie d'État « Kiji ». En 1977, il a de nouveau changé de statut, devenant une branche du musée local d'État de Carélie. Depuis 1991, le musée a acquis son autonomie et s'appelle « Musée municipal de Medvejegorsk ».