En 1961, Víctor Petrovich Ershov, profesor de geografía en la escuela interna No. 4 de Medvézhyegorsk, organizó excursiones de estudios locales con sus alumnos por los alrededores. Como resultado de estas excursiones, se recolectaron numerosos hallazgos que se convirtieron en las primeras exposiciones del museo escolar. El 7 de abril de 1962, se inauguró el Museo Histórico y de Estudios Locales de Medvézhyegorsk, que inicialmente llevaba ese nombre.

En el primer año de funcionamiento, el museo fue visitado por más de mil personas. El director del museo fue Víctor Petrovich Ershov, quien continuó organizando excursiones y recolectando nuevas exposiciones para la colección junto con sus alumnos.

En 1969, por decisión del Consejo de Ministros de la República Socialista Soviética de Carelia, el museo escolar fue transformado en una sucursal del Museo Estatal Histórico, Arquitectónico y Etnográfico Reserva «Kizhi». En 1977, cambió nuevamente su estatus, convirtiéndose en una sucursal del Museo Estatal de Estudios Locales de Carelia. Desde 1991, el museo obtuvo autonomía y pasó a llamarse «Museo Municipal de Medvézhyegorsk».