Le monastère a commencé son histoire en 1863 en tant qu'hospice sous la direction de Neoniila Chestnova. Cet événement a eu lieu grâce à l'initiative de riches marchands de Vyksa qui ont décidé de créer un hospice. Pour choisir l'emplacement, ils ont invité le révérend Varna de la Laure de la Sainte-Trinité de Sergueï. Arrivé à Vyksa, il s'est dirigé vers la forêt et a planté une branche au cœur de celle-ci, où la maison a été construite. Trois moniales, 12 résidentes et le fou Dimitri Pivovarov, qui les protégeait des dangers, s'y sont installés. À l'automne 1864, la construction d'un bâtiment à deux étages avec des cellules et une salle à manger était achevée. Un an plus tard, Varna a envoyé une icône Iverskaya de la Mère de Dieu à l'hospice, ce qui a déterminé sa dédicace. Il y a environ cent ans, les iconographes du monastère ont créé une liste miraculeuse à partir de celle-ci, car l'icône originale du vieux Varna ne s'est pas conservée. En 1868, la première église domestique a été consacrée en l'honneur de l'icône Iverskaya. En 1872, la construction d'une cathédrale à cinq dômes, pouvant accueillir 6000 priants, a commencé. Le statut de communauté d'hospice a été obtenu en 1874, et jusqu'en 1882, elle a été dirigée par Maria Pivovarova, sous laquelle la cathédrale en pierre a été achevée. À partir de 1882, la communauté a été dirigée par Mitrofanija Kryukova du monastère de Sofia à Rybinsk, et sous sa direction, les résidentes ont obtenu le statut de monastère.

Pendant les années soviétiques, le sort de la communauté Iverskaya a été tragique. En 1919, le monastère a été fermé, et à l'été 1927, le temple principal a été dynamité, détruisant ses dômes et ses voûtes. Les murs principaux ont tenu bon et sont devenus la base pour la future restauration, bien que sous les décombres, des sœurs schismatiques aient péri, refusant de quitter le monastère. La même année, le clocher a été abattu jusqu'aux niveaux inférieurs. On dit que la personne responsable de l'explosion ne voulait pas le faire et a posé une charge faible, qui n'a fait tomber que le dôme et le niveau supérieur. Dans la maison du vieux Varna, située en dehors du monastère, vivait L. M. Kaganovich lorsqu'il venait inspecter les usines. La renaissance de la communauté a commencé à la fin du XXe siècle. En 1991, une communauté religieuse a été enregistrée, en 1993, une nouvelle église Iverskaya a été aménagée dans la librairie de l'église. En 1994, les architectes ont établi un passeport pour l'ensemble monastique, et il a été placé sous protection en tant que monument d'importance régionale. Une liste de l'icône Iverskaya de la Mère de Dieu, restaurée au monastère de Serafimo-Diveevo, est revenue dans la paroisse. Lors du déblaiement des restes de la cathédrale de la Trinité, une autre icône, celle de Tikhvin, a été trouvée. En 1997, la communauté est redevenue un monastère. La restauration du temple principal a commencé, et en 2003, le vestibule a été consacré. Il reste encore loin d'une restauration complète, mais le travail continue. Dans la maison du vieux Varna, un foyer pour filles orphelines a été aménagé sous la supervision de la supérieure. Une maison d'accueil et une salle à manger pour les pèlerins ont été ouvertes. Dans le bâtiment de l'ancienne auberge marchande, l'école spirituelle orthodoxe de Vyksa a été installée avec un musée du monastère Iversky, où sont exposées des photos, des documents et des artefacts trouvés lors de la restauration. La restauration du clocher a commencé en 2011. Le 8 février 2012, un dôme pour l'église de l'Assomption, fabriqué à Pereslavl-Zalessky, a été livré au monastère, assemblé et doré à l'usine métallurgique de Vyksa. Le 2 avril 2012, le métropolite Georgy a consacré les croix et les dômes pour l'église de l'Assomption et les cloches. Le 23 octobre de la même année, l'évêque Varna a consacré le dôme et la croix, qui ont été installés le même jour sur le clocher en construction.

Le 9 février 2016, l'évêque Varna a consacré l'église en l'honneur de l'Assomption de la Mère de Dieu avec un grand rite. Au centre de la place formée par la construction, un monument au révérend Varna de Gethsémani a été installé, inauguré solennellement le 22 mai 2011.