Il y a plus de trois cents ans, le patriarche de Moscou et de toute la Russie, Joakim, a béni le prince Mikhaïl Tcherkasski, propriétaire du village d'Ostankino, pour la construction d'une nouvelle église en pierre à la place de l'ancienne en bois, consacrée à la Sainte Trinité. Le prince prévoyait d'ajouter deux chapelles : au nom de la Sainte Vierge de Tikhvine et de saint Alexandre de Svir. Il a demandé la permission de construire à un nouvel endroit en raison d'une épidémie qui avait laissé de nombreuses sépultures sur l'ancien site. La demande de construction a été soumise en septembre 1678.

Le village d'Ostankino est connu depuis 1548, après le Temps des troubles, il est devenu la propriété du prince Ivan Borisovitch Tcherkasski. En 1617, il y avait déjà une église au nom de la Sainte Trinité, des terres agricoles, un étang, un moulin, le hameau de Boyarkina, la cour des boyards et la rivière Kopytenka, qui a ensuite été canalisée. Le personnel de l'église se composait d'un prêtre, d'un diacre et d'un sacristain, qui était également le sonneur de cloches.

En 1625 et 1627, une nouvelle église en bois a été construite. Le domaine est passé au prince Iakov Koudentovitch Tcherkasski, puis au prince Mikhaïl Iakovlevitch Tcherkasski, qui a décidé de construire une église en pierre. Son fils aîné, Piotr, a épousé la princesse Maria Borisovna Golitsyna, et le cadet, Agrafena Lvovna Narychkina. Le prince Tcherkasski était un grand propriétaire terrien, possédant 9083 foyers. Ostankino était le principal domaine des Tcherkasski dans la région de Moscou. Le prince a beaucoup construit : des églises au monastère de Novo-Spasski, dans le village de Nikolskoye, sur le territoire du Kremlin et ailleurs.

Ostankino était la résidence principale des Tcherkasski. Le nouveau temple, situé près du domaine, est devenu leur église domestique avec trois chapelles. Des personnalités éminentes, y compris des membres de la famille impériale, s'arrêtaient souvent ici en route vers le monastère de la Trinité-Saint-Serge. En 1856, avant la visite de l'empereur Alexandre II, le retable a été rénové. Le retable de l'église est intéressant par son architecture, qui rappelle un orgue.

Au XVIIIe siècle, Ostankino est resté la résidence principale des Tcherkasski, mais avec le transfert de la capitale à Saint-Pétersbourg, les propriétaires y venaient moins souvent. Dans les années 1730, Ostankino a de nouveau pris de l'importance, et le prince Tcherkasski y passait l'été avec sa famille. Le domaine a été visité par l'impératrice Anna Ioanovna et Élisabeth Pétrovna. Après la mort du prince en 1742, sa fille Varvara épousa le comte Piotr Cheremetiev. Ostankino est tombé dans l'oubli, mais après la mort de Varvara en 1767, le comte Piotr Borisovitch a modifié l'apparence de l'église.

Au XIXe siècle, les Cheremetiev ont déménagé à Saint-Pétersbourg. Le comte a fait des dons pour la construction d'institutions caritatives, y compris l'Institut d'urgence nommé d'après Sklifosovski. Après sa mort, le domaine est passé au prince Dmitri Nikolaïevitch, sous lequel l'église a été restaurée. Ostankino est devenu un lieu populaire pour les promenades. En 1856, l'empereur Alexandre II a choisi Ostankino pour se préparer à sa couronnement. L'église a été rénovée, les icônes ont été restaurées, et les murs repeints.

Le comte Dmitri Cheremetiev était pieux et vénérait souvent les reliques. En 1866, il a amené l'icône de la Mère de Dieu d'Iver à Ostankino. En 1875, le comte Alexandre Dmitrievitch Cheremetiev a commencé des travaux de réparation et de restauration de l'église.

En 1919, la paroisse est descendue dans le sous-sol en raison de la pauvreté. En 1922, des objets de valeur ont été retirés de l'église. Dans les années 1930, l'église est devenue une partie du musée antireligieux. Pendant la guerre, le bâtiment a été utilisé comme entrepôt. Dans les années 1970, la restauration a commencé. En 1991, le patriarche Alexis II a consacré l'autel en l'honneur de la Sainte Trinité Vivifiante. En 1994 et 1996, les chapelles ont été consacrées. Aujourd'hui, il y a un couvent patriarcal, et une communauté orthodoxe a été créée. Dans les moments difficiles et lors des fêtes, la fraternité prie pour le salut de la Russie et de tous les chrétiens orthodoxes.