L'église Pierre et Paul est devenue la première église funéraire à Nizhny Novgorod. En 1763, lorsque la Commission sur la construction en pierre de Saint-Pétersbourg et de Moscou a commencé la réorganisation régulière des villes russes, elle a rencontré de sérieuses difficultés en raison des cimetières près des églises paroissiales. L'aménagement des rues à travers ces territoires a suscité le mécontentement des habitants.

En 1775, à Nizhny Novgorod, à une demi-verste de la grille de Varvara, un espace libre a été désigné pour un cimetière municipal, où une chapelle a été installée et une clôture a été érigée.

En 1781, selon le projet du premier architecte provincial Yakov Ananyin, le bâtiment de l'église Pierre et Paul a été construit, mais le maître-autel en l'honneur de Pierre et Paul n'a été consacré qu'en 1785.

Dans les années 60 du XXe siècle, à l'époque soviétique, le bâtiment de l'église abritait le cinéma "Pioner".

Dans les années 1990, l'église des Saints Apôtres Pierre et Paul à Nizhny Novgorod a été restituée aux croyants.

Le bâtiment de l'église est sans colonnes, avec un octogone baroque lumineux sur un carré, une salle de repas et un clocher à trois niveaux au-dessus de l'entrée ouest, conçu comme un navire. Le clocher a été détruit à l'époque soviétique, et en 2014, un nouveau clocher à deux niveaux avec un toit en forme de dôme a été construit à sa place. Les encadrements de fenêtres baroques sont taillés dans la brique. L'église est le seul monument de baroque russe de la seconde moitié du XVIIIe siècle encore conservé à Nizhny Novgorod.