L'église de Saint Jean Baptiste à Kalouga a été construite en 1735 sur le site d'une ancienne structure en bois. En 1754, elle a été gravement endommagée par un incendie qui a détruit une grande partie de la ville. Le feu a pratiquement complètement détruit l'intérieur et les icônes de l'église, à l'exception de l'image de Jean Baptiste.

La restauration de l'église a été achevée en 1763 grâce aux efforts du prêtre Nikita Egorovitch Popov et des paroissiens qui ont rassemblé les fonds nécessaires. Deux chapelles ont également été ajoutées : l'une en l'honneur de Serge de Radonège, l'autre en l'honneur des martyrs Gouri, Samon et Avive. Pour la décoration intérieure, un marbre artificiel de différentes couleurs a été utilisé.

À la fin du XIXe siècle, des réparations ont été effectuées dans l'église, au cours desquelles les murs ont été repeints et les sols recouverts de parquet. Les fresques étaient basées sur des copies d'images de l'église du Christ Sauveur à Moscou et de la cathédrale de Vladimir à Kiev. Le retable à sept niveaux a été rénové sur une nouvelle toile, mais sur d'anciennes planches, selon les esquisses des artistes Vassiliev, Nesterov, Makovsky et Sorokin. L'icône ancienne de Jean Baptiste et l'icône des martyrs Gouri, Samon et Avive étaient particulièrement vénérées.

De l'extérieur, l'église apparaît majestueuse et richement ornée. La partie principale du bâtiment a une forme quadrangulaire avec de nombreuses fenêtres. Aux coins de la partie supérieure se trouvent quatre petites coupoles, menant à un sommet en forme de rotonde avec un dôme rond, parsemé d'étoiles sur fond bleu. Le clocher à trois niveaux de style gothique a été construit en 1784. Aux coins des deux premiers niveaux se trouvent trois colonnes, reliées par une flèche au deuxième niveau. Le niveau supérieur a été modifié lors des réparations dans les années 1890.

En 1929, l'église a été fermée, bien que certaines sources indiquent 1934, car la communauté ne pouvait pas effectuer de réparations majeures. Au milieu des années 1950, l'autel donnant sur la rue Moscou a été démonté, car il gênait la circulation automobile. Depuis 1960, l'église est reconnue comme monument d'architecture et d'urbanisme d'importance républicaine.

Jusqu'en 1995, le bâtiment de l'église abritait un collège de culture. Le 7 août 1995, l'église a été transférée à l'Éparchie de Kalouga de l'Église orthodoxe russe. Le 15 août 1997, un accord a été signé entre la Direction de la protection des monuments et l'Éparchie de Kalouga concernant la préservation et l'utilisation du monument.

Actuellement, l'église est complètement restaurée à l'extérieur, et les travaux de décoration intérieure et de peinture des murs sont en cours. Le 29 janvier 2007, le gouvernement de la Fédération de Russie a transféré l'église à la propriété de l'Éparchie de Kalouga de l'Église orthodoxe russe.