L'église de la Nativité de la Sainte Vierge dans le désert de Bogorodichno-Rozhdestvenskaya a été construite en 1796 grâce aux fonds de la famille noble Poznyakov, Alexandre Adriyanovich et Anna Vassilievna. L'architecture de l'église est réalisée dans le style Empire. Elle possède deux autels : le principal est consacré à la Nativité de la Sainte Vierge, et le second, en l'honneur des saints Cosme et Damien de Rome.

Après la révolution de 1917, l'église a fonctionné jusqu'en 1938, lorsque, sur la base d'une affaire fabriquée, le supérieur archimandrite Euphrosin (Fomin) et le président du conseil paroissial Andreï Anokhin ont été arrêtés et exécutés, tandis que la doyenne Elena Kondratieva a été condamnée à 10 ans de camps. Après la fermeture de l'église, tous ses biens ont été confisqués et le verger a été abattu. Pendant l'occupation fasciste, les Allemands ont utilisé le bâtiment de l'église pour abriter du bétail. Dans les années 1950, l'église a été rouverte. Sa restauration a été assurée par le prêtre André Pavlikov, colonel à la retraite et participant à la Grande Guerre patriotique, décoré de nombreuses ordres. Le père André a servi dans l'église pendant 17 ans et s'est occupé des moines qui s'étaient installés dans les villages environnants après la fermeture des monastères. Au départ, les services étaient célébrés dans la petite chapelle en l'honneur de Cosme et Damien, puis le grand autel a été restauré.

Le 28 février 1972, l'igoumène de l'église est devenu l'hiéromoine Arkadi (Afonin), moine de la Laure de la Trinité-Saint-Serge. Il a servi avec interruption du 1er avril 1974 au 1er septembre 1975 jusqu'au 25 mars 1991, date à laquelle il a été nommé évêque de Sakhaline du Sud. Avec la bénédiction de l'évêque de Kalouga et Borovsk Donat (Shchegolev), le père Arkadi a commencé à créer une communauté monastique féminine. Il a construit près de l'église une maison avec des cellules pour les sœurs et a invité des moniales expérimentées, ayant été tonsurées dans de vieux monastères. Dans la communauté se sont installées la moniale Anastasia (Kouzmine), la schimoniale Marfa, tonsurée par le hiéromoine Meléti (Barmine) d'Optina, la schimoniale Tikhon, les moniales Dorofeya, Nikodim, Agnia, Ksenia, la moniale aveugle Iulia et d'autres. Des jeunes sœurs ont également rejoint la communauté, dont trois ont pris le voile monastique et quatre, le voile de novice.

Avec l'ouverture de nouveaux monastères et en raison de l'âge avancé des sœurs, au début des années 1990, il ne restait que quatre membres dans la communauté. Le 4 avril 1993, avec la bénédiction de l'archevêque Clément, plusieurs membres de la communauté du monastère Saint-Nicolas de Tchernostrov ont été envoyées à Baryatino pour renforcer la communauté. La moniale Théophila (Lepeshinskaya) a été nommée sœur aînée. La communauté a commencé à se développer : de nouveaux bâtiments ont été construits et le nombre de membres a augmenté. Le 26 décembre 1995, par décision du Saint-Synode de l'Église orthodoxe russe, la communauté monastique a été transformée en monastère féminin, le désert de Bogoroditsé-Rozhdestvenskaya, et la moniale Théophila est devenue l'abbesse.