Le musée-réserve « Phanagoria », fondé en 2014, se trouve sur le site d'un monument archéologique, les ruines de l'ancienne ville de Phanagoria, qui a existé pendant plus de 1500 ans et a probablement été détruite à la suite d'une invasion ennemie.

L'unicité de cet endroit réside dans le fait que le site archéologique est presque entièrement exempt de constructions modernes. Cela permet de préserver l'intégrité de l'environnement historique et culturel naturel et de mener des expéditions académiques, poursuivant des recherches de longue date sur l'histoire de la ville.

La collection d'artefacts uniques, trouvés lors des fouilles à Phanagoria et dans ses environs, raconte la vie des colons grecs sur le territoire de la Russie moderne et les événements qui s'y sont déroulés à l'époque antique et médiévale.