Petr Ivanovich Choukine était l'un des plus grands collectionneurs de Russie dans la seconde moitié du XIXe siècle. Il était issu d'une famille de citoyens honoraires, était conseiller d'État effectif, marchand et mécène, ainsi que créateur d'un musée privé des "Antiquités russes".

En 1891, Choukine acquit un terrain rue de la Petite Géorgie, où, un an plus tard, l'architecte B.V. Freidenberg construisit un "château féerique", qui abritait sa collection. Celle-ci était connue pour sa diversité et comprenait des armes, des tissus, des tapis, des peintures, des gravures, des objets d'église, de la vaisselle et des bijoux. La bibliothèque occupait une place particulière. Depuis 1895, le musée était accessible à tous, et Petr Ivanovich guidait personnellement les visites et commentait les expositions. Des artistes célèbres tels qu'A. Vassiliev, V. Serov et V. Surikov y ont travaillé. De nombreux éléments de décoration étaient inspirés de l'architecture russe du XVIIe siècle.

En 1905, Choukine a transféré sa collection avec le terrain et les bâtiments au Musée historique. L'hôtel particulier est devenu une partie du Musée historique impérial de Russie nommé d'après l'empereur Alexandre III, connu sous le nom de Musée P.I. Choukine. Au moment du transfert, la collection surpassait tous les fonds du Musée historique. Choukine est resté le conservateur de la collection jusqu'à sa mort, l'enrichissant et publiant des catalogues. Après sa mort en 1912, le musée a cessé d'exister et les collections ont été transférées au Musée historique.

De 1923 à 1924, les bâtiments abritaient les fonds du Musée de l'Ancienne Moscou, puis le Musée de l'Industrie Centrale de la région s'y est installé. En 1928, l'hôtel particulier a été transformé en résidence étudiante. En 1934, deux des trois bâtiments de l'hôtel particulier sont devenus une partie du Musée d'Histoire Naturelle d'État nommé d'après K.A. Timiryazev. Ce n'est qu'en 1995 que le complexe muséal a obtenu le statut de monument d'urbanisme et d'architecture d'importance fédérale.