La maison a été construite en 1852 et, dix ans plus tard, achetée par P. D. Diaghilev, un fonctionnaire à la retraite du ministère des Finances, originaire de Perm, qui était le grand-père de S. P. Diaghilev. Il a réaménagé le bâtiment selon le projet de l'architecte provincial R. I. Karvovsky dans le style du néoclassicisme russe tardif.

Pendant trente ans, la maison a appartenu à la grande et chaleureuse famille Diaghilev. Dans cette maison, que les contemporains appelaient les « Athènes de Perm », l'intelligentsia de la ville se réunissait le jeudi. Des soirées musicales y étaient organisées, des chants étaient interprétés et des spectacles domestiques joués.

Dans les années 1880, la famille de Pavel Pavlovich Diaghilev, le père de S. P. Diaghilev, y vivait, ayant déménagé à Perm depuis Saint-Pétersbourg.

L'atmosphère spirituelle de la maison et le culte de l'art ont contribué à la formation de la personnalité créative de Serge Diaghilev, futur réformateur du théâtre et organisateur de la société « Monde de l'Art », ainsi que des triomphales « Saisons russes » à Paris et de la compagnie « Ballet russe de Diaghilev ». Il a reçu une bonne éducation musicale et a participé activement à des concerts tant à la maison qu'au gymnase. En 1891, la maison a été rachetée par la société municipale et le zemstvo du district de Perm après le déménagement de la famille Diaghilev à Saint-Pétersbourg. Du 19 mai 1893 au 19 mai 1894, le bâtiment a abrité la succursale de Perm de la Banque d'État.

Depuis 1925, une école n° 21 s'y est installée, qui a été transformée en école n° 11 en 1926 et 1927. Depuis 1992, elle porte le nom de gymnase S. P. Diaghilev.

Le musée, qui constitue un ensemble avec le gymnase, possède des collections uniques. Sa collection comprend des documents et des photographies liés à la période permienne de la famille Diaghilev, des objets de la vie de domaine de leurs résidences d'été dans la province de Perm, une photographie de 1924 avec l'imprésario et célèbre artiste et dramaturge français J. Cocteau, une partie des archives personnelles, des livres et des costumes de théâtre de Y. Zorich, danseur de la troupe « Ballet russe à Monte-Carlo », créée par S. P. Diaghilev.

En 2007, un monument à S. P. Diaghilev, réalisé par le sculpteur Ernst Neizvestny, a été installé dans la salle de concert de la Maison Diaghilev.

Le 19 août 2013, lors de la Journée de la mémoire du grand impresario, l'inauguration solennelle du panneau commémoratif rénové sur la maison familiale des Diaghilev a eu lieu. Cet événement s'est déroulé dans le cadre du projet « La seconde vie du monument ».