La casa fue construida en 1852 y, diez años después, comprada por P. D. Diaghilev, un funcionario retirado del Ministerio de Finanzas y nativo de Perm, quien era el abuelo de S. P. Diaghilev. Él remodeló el edificio según el proyecto del arquitecto provincial R. I. Karvovsky en el estilo del clasicismo ruso tardío.

Durante treinta años, la casa perteneció a la gran y unida familia Diaghilev. En esta casa, que los contemporáneos llamaban "Las Atenas de Perm", se reunía la intelectualidad de la ciudad los jueves. Aquí se organizaban veladas musicales, se cantaba y se representaban obras de teatro en casa.

En la década de 1880, aquí vivía la familia de Pavel Pavlovich Diaghilev, el padre de S. P. Diaghilev, quien se mudó a Perm desde San Petersburgo.

La atmósfera espiritual de la casa y el culto al arte contribuyeron a la formación de la personalidad creativa de Sergey Diaghilev, futuro reformador del teatro y organizador de la asociación "Mundo del Arte", así como de los triunfales "Seasons Rusos" en París y la compañía "Ballet Ruso de Diaghilev". Recibió una buena educación musical y participó activamente en conciertos tanto en casa como en la escuela secundaria. En 1891, la casa fue comprada por la sociedad urbana y la tierra del distrito de Perm después de que la familia Diaghilev se mudara a San Petersburgo. Desde el 19 de mayo de 1893 hasta el 19 de mayo de 1894, en el edificio se encontraba la sucursal del Banco Estatal de Perm.

Desde 1925, aquí se estableció la escuela n.º 21, que en 1926 y 1927 fue transformada en la escuela n.º 11. Desde 1992 lleva el nombre de la gimnasia S. P. Diaghilev.

El museo, que forma un complejo único con la gimnasia, posee colecciones únicas. En su colección hay materiales documentales y fotografías relacionadas con el período permiano de la familia Diaghilev, objetos de la vida de la mansión de sus propiedades de verano en la provincia de Perm, una fotografía de 1924 con el impresario y famoso artista y dramaturgo francés J. Cocteau, parte del archivo personal, libros y trajes teatrales de Y. Zorich, bailarín de la compañía "Ballet Ruso en Montecarlo", creada por S. P. Diaghilev.

En 2007, se erigió un monumento a S. P. Diaghilev en la sala de conciertos de la Casa Diaghilev, obra del escultor Ernst Neizvestny.

El 19 de agosto de 2013, en el Día de la Memoria del gran impresario, se llevó a cabo la inauguración solemne del renovado panel conmemorativo en la casa familiar de los Diaghilev. Este evento se realizó en el marco del proyecto "Segunda vida del monumento".