Le marchand d'Ekaterinbourg Fiodor Alexeïevitch Mikhailov, gravement malade, a légué en 1885 500 roubles avec intérêts par l'intermédiaire du clergé de la cathédrale d'Ekaterinbourg pour la construction d'une église funéraire au nouveau cimetière, connu sous le nom de Mikhailovska. C'était sa première contribution. Le 13 octobre 1886, il a fait un deuxième don de 300 roubles avec intérêts, également au clergé de la cathédrale d'Ekaterinbourg pour la construction de l'église au cimetière. Étant donné que la construction de l'église nécessitait 12 000 roubles, la contribution de Mikhailov était significative et première. C'est pourquoi l'église est communément appelée Mikhailovska.

L'église a été posée le 8 juin 1886 et consacrée le 17 juin 1900 par l'Ordinaire Polikarp, évêque d'Ekaterinbourg et d'Irbit.

La construction a été réalisée exclusivement avec les fonds des marchands Yakov Prokhorovitch Andreev, Konioukhov, Alexandre Alexeïevitch Volkova et d'autres. Ils ont choisi un lieu de repos éternel près de l'église. Le marchand Mikhailov est décédé à la fin de 1886. Sa maison a été conservée, bien qu'elle ait été fortement reconstruite, et après sa mort, elle a été achetée par l'avocat Magnitski. La maison est située rue Kolobovska, aujourd'hui rue Tolmacheva, N21.

En 1918, l'église de Tous les Saints a été gravement endommagée par un incendie, et les réparations ont duré deux ans. Pendant ce temps, le bâtiment du temple a reçu d'intéressantes fresques murales, réalisées d'après des cartons sous la direction de P.M. Vassnetsov.

Après la scission des églises en 1922, l'église Mikhailovska a été transférée à la communauté "rénovationniste" et est devenue pendant un certain temps la cathédrale des rénovateurs. Au cours des décennies suivantes, le temple a été fermé deux fois, son ornement et ses fresques ont été pillés. Depuis 1965, il a longtemps abrité une boutique de fleurs de la société de services funéraires, et l'autel a été profané.

L'église Mikhailovska a été restituée aux croyants à la fin de 1989 après deux ans de lutte de la communauté religieuse contre les autorités. En novembre 1990, l'archevêque Melchisédech a consacré l'autel au nom de Tous les Saints. Depuis ce temps et jusqu'à présent, le recteur est le prêtre Vladimir Pommer. Grâce à ses efforts et à ceux de la paroisse, le temple est aménagé, un espace de baptême, un centre spirituel et une chapelle ont été construits.