En 1675, sur le site de l'église en bois, une église en pierre, la cathédrale de l'Assomption, a été construite, où est apparue l'icône de la Mère de Dieu de Yakhroma. Le tsar Alexis Mikhaïlovitch a alloué 300 roubles et 100 pouds de fer pour sa construction. Dans la cathédrale, sous le sol, reposaient les reliques du saint Cosme. L'église a été rénovée en 1837 sous l'abbé Cyprien, et en 1867, un nouvel iconostase a été installé et des fresques ont été réalisées sous l'abbé Naoum. En 1906, un chauffage central a été installé dans la cathédrale de l'Assomption.

Lors de la construction de la nouvelle cathédrale en pierre de l'Assomption, l'ancienne église en bois a disparu, tout comme l'église en l'honneur de la grande martyre Paraskeva, mentionnée dans les inventaires de la première moitié du XVIIe siècle. Dans cette église, selon les inventaires de 1619 et 1635, reposaient les reliques du fondateur du monastère, et dans l'église se trouvait le reliquaire du miracle de Cosme, recouvert de son image. Il est probable que la nouvelle église ait été construite à l'emplacement de deux églises en bois, l'Assomption et Paraskeva.

En 1832, après la canonisation de saint Mitrophane de Voronej, une chapelle à son nom a été aménagée au-dessus de la salle à manger de l'église de l'Image Non-Faite. Dans la partie sud du sanctuaire principal de l'église de l'Assomption, la chapelle en l'honneur du fondateur du monastère, le saint Cosme de Yakhren, a été renouvelée. Un deuxième étage a été ajouté au bâtiment des cellules des abbés et des frères, et l'église de Nicolas a été reconstruite.

Pendant les années de révolution et de pouvoir soviétique, le sort du monastère de Kosma a été similaire à celui de nombreux monastères et églises fermés et défigurés. Selon les souvenirs des habitants locaux, une partie des moines a quitté le monastère en 1918, probablement en raison du manque de moyens de subsistance. Le monastère a été fermé en 1923, et son complexe a été utilisé pour les besoins du nouveau pouvoir. La « propriété » a été « nationalisée » et transférée au Musée régional de Vladimir, qui a emporté tous les objets de valeur.

Après la formation du district de Nebyloï en 1935, diverses organisations se sont installées dans le monastère. Un club a été ouvert dans la cathédrale de l'Assomption, puis une cantine et une boulangerie. Les habitants racontaient que la cantine se transformait en cabaret le soir. Les anciens se souviennent comment, en 1936, les cloches ont été retirées et brisées : « Les hommes de Nebyloï brisaient une grande cloche de cent pouds, et les gens se tenaient là et pleuraient ». Plus tard, le clocher a été détruit et les dômes, qui couronnaient les églises du monastère, ont été démolis.

En 1995, le monastère a reçu le statut de monastère, confirmé par la décision du Saint-Synode du 27 décembre 1996. En novembre de la même année, l'ensemble du complexe monastique a été restitué à l'Éparchie de Vladimir. Dans la cathédrale de l'Assomption, sous le sol, reposent les reliques du saint Cosme.