L'église de l'Assomption de la Mère de Dieu était le premier temple de la désert de Vyshen, ce qui a donné à la communauté le nom de Sainte-Assomption. Selon le document de transfert de la vieille Marfa Ioannovna, le temple se trouvait à l'origine dans l'ancien monastère sur la rive opposée de la rivière Vysha et a été déplacé à un nouvel endroit en 1625. L'église en bois a brûlé dans un incendie, et sous l'abbesse Dosiphia, elle a été reconstruite en pierre. La construction s'est achevée en 1761, et la consécration a eu lieu l'année suivante. Le temple avait deux chapelles : au nom de saint Nicolas de Myre et du vénérable Serge de Radonège. Depuis le XIXe siècle, il y avait une relique monastique ici, l'icône miraculeuse de la Mère de Dieu de Kazan. En 1774, peu après l'édification de l'église en pierre, elle a été pillée par les troupes de Pugatchev. À la fin du XIXe siècle, le temple est devenu trop petit pour les paroissiens.

Comme il a été noté dans la "Description historique et statistique de l'Éparchie de Tambov", publiée au début du XXe siècle, "cette église est solide dans sa construction, mais peu attrayante en apparence et irrégulière dans son architecture". Après la consécration de la nouvelle cathédrale de la Nativité du Christ en 1890, l'église de l'Assomption est restée inutilisée jusqu'à la fermeture de la communauté de Vyshen en 1923. Les bolcheviks ont transféré le temple à "la ville des enfants nommée d'après le IIIe Internationale", y installant un théâtre, enlevant le retable et en peignant les fresques murales. Plus tard, le bâtiment a été utilisé par un hôpital psychiatrique, qui s'est installé sur le territoire du monastère. Les habitants racontent qu'un jour, les dômes du temple ont été démontés, et le fer a été utilisé pour fabriquer des seaux pour nourrir les cochons.

Au début des années 1990, l'église était dans un état lamentable. En 1996, son dôme s'est effondré de manière inattendue, et l'année suivante, le bâtiment a été restitué au monastère. L'église de l'Assomption est devenue la première dans la communauté où des travaux de restauration ont commencé. Elle a été consacrée le 21 juin 1998, et depuis lors, des services réguliers ont repris au monastère de Sainte-Assomption de Vyshen. Le 29 juin 2002, les reliques de saint Théophane le Reclus de Vyshen ont été transférées dans l'église de l'Assomption depuis l'église du vénérable Serge de Radonège dans le village d'Emmanuilovka. Elles y sont restées jusqu'en 2009, lorsqu'elles ont été placées dans la cathédrale de Kazan restaurée et consacrée.