Le temple est situé sur le territoire du couvent de la Sainte-Trinité de Diveevo à Nijni Novgorod, ouvert en 1997.

Le quartier de la place de la Croix, désormais connu sous le nom de place Lyadova et rue Polévaïa, la rue moderne de Gorki, a commencé à être activement construit à partir du milieu du XIXe siècle. Les habitants de la nouvelle partie de la ville ont insisté pour que les autorités religieuses construisent une église dans ce quartier, car la plus proche église de la Protection était difficile d'accès en raison des ravins profonds et des rivières tumultueuses au printemps et à l'automne.

L'évêque Jérémie a soutenu le désir des paroissiens et a demandé au gouverneur militaire F. V. Annenkov de désigner un emplacement pour la construction d'une nouvelle église. L'intersection des rues Kanatnaïa et Allemande a été choisie. Son Éminence a également déterminé la consécration de la future église : « afin que la région et l'église soient consacrées au nom des saints patrons de la Russie, gardiens des traditions apostoliques, enseignants de l'orthodoxie et protecteurs de notre patrie Pierre, Alexis et Ion.

L'architecte de l'église était N. I. Oujoumedski-Gritsevitch, et en avril 1859, la pose des fondations a commencé. L'année suivante, l'église en pierre était entièrement construite. À l'intérieur, le sol était pavé de pierre blanche, trois iconostases sculptés étaient installés, les voûtes étaient ornées de fresques, et les murs étaient recouverts de toiles représentant des saints. Sept cloches sur le clocher de l'église réjouissaient les habitants de Nijni Novgorod par leur tintement.

À la fin de 1860, il a été rapporté au Synode que l'église en pierre de la Sainte-Trinité à Nijni Novgorod avait été érigée « dans toutes ses parties solidement, harmonieusement et proprement ».

Le 1er décembre 1860, l'évêque de Nijni Novgorod Nectaire a consacré le maître-autel de l'église en l'honneur de Pierre, Alexis et Ion, les miracles de Moscou. Le 14 décembre, le chœur droit a été consacré en l'honneur de l'apôtre Jason et de Nicolas le Miracleux, et le 16 décembre, le chœur gauche en l'honneur de l'évangéliste Luc.

Au XXe siècle, l'église de la Sainte-Trinité a partagé le sort de nombreux temples en Russie. Après la révolution de 1917, le temple a été saccagé, et une auberge a été aménagée dans la salle de prière. En 1998, la restauration de l'église a commencé grâce aux fonds du couvent de la Sainte-Trinité de Diveevo.

Le 11 juin 2004, l'évêque de Nijni Novgorod et d'Arzamas Georges a consacré le maître-autel au nom des saints Pierre, Alexis, Ion, Philippe et Ermogène, miracles de Moscou et de toute la Russie, dont la mémoire est célébrée le 18 octobre.