L'idée de construire l'église est née en 1861 grâce au marchand P. Tatarinov, qui a fait don de 6 000 roubles pour la pose de la première pierre, qui a eu lieu en 1863. Cependant, la mort du marchand la même année a interrompu le projet, et ses héritiers ont refusé de poursuivre la construction, la transférant à un monastère féminin. Des fonds supplémentaires ont été fournis par des marchands de Troïtsk, tels qu'I. Vassiliev et K. Syromyatnikov.

Le 16 juin 1862, le Saint-Synode a autorisé la construction d'un nouveau temple monastique pour le monastère de Kazan, l'église de la Transfiguration du Seigneur. La pose de la première pierre a eu lieu le 9 juin 1863 sous la direction du prêtre Gabriel Amanatski, du Saint-Synode. La construction a duré quatre ans et a été financée par des dons privés des habitants de Troïtsk : le marchand I. Vassiliev a fait un don de 10 000 roubles, les veuves de marchands E. Bakakina et E. Tatarinova, 6 et 2,3 mille roubles respectivement, ainsi que des fonds provenant du maire V. Pupyshev. À l'été 1870, la construction a été achevée. L'église est devenue la plus grande structure du monastère de Kazan et représente un style classique en croix avec coupole. Sa caractéristique architecturale, son élévation vers le ciel, donne à l'édifice une apparence légère et aérienne. Cinq croix dorées ont été installées sur l'église, un iconostase en bois sculpté doré à trois niveaux, et dans la coupole sont représentés quatre anges flottants. L'éclairage était assuré par un chandelier en cuivre argenté et des lampes en argent, l'église était richement ornée de 89 icônes. Le 1er octobre 1870, elle a été consacrée en présence du comte Berg, aide de camp de Sa Majesté l'Empereur. Avant la cérémonie, l'église a reçu en cadeau une icône du Grand Martyr et Médecin Panteleimon dans un cadre doré sculpté.

Le 22 juillet 1891, le tsarévitch Nicolas, futur empereur Nicolas II, a visité Troïtsk et le monastère de l'église de la Transfiguration, offrant à l'église une icône de saint Nicolas le Miracleux, qui y est toujours conservée.

Dans les premières années du pouvoir soviétique, le monastère a continué ses activités, mais en 1922, il a été fermé, comme de nombreuses institutions religieuses. En 1927, les bâtiments monastiques ont été transférés à des fins culturelles et éducatives, et depuis lors, leurs propriétaires ont changé à plusieurs reprises. Avant la guerre, il y avait les 47e et 48e brigades de cavalerie, pendant la Grande Guerre patriotique, une école militaire de pilotage, et en 1947, les bâtiments ont été transférés à une école de formation aéronautique. L'église de la Transfiguration est devenue une salle de sport, et l'église de Kazan a été démolie en 1949.

Le premier pas vers la renaissance du monastère a été fait en 1991, lorsque la direction de l'école de formation aéronautique a demandé au Conseil de l'église de l'église Dimitrievskaya d'accepter l'église de la Transfiguration dans le bilan de l'église. La communauté monastique a été recréée en 1996, et l'église de la Transfiguration a été restaurée.