La idea de construir el templo surgió en 1861 gracias al comerciante P. Tatarinov, quien donó 6 mil rublos para la colocación de la iglesia, que tuvo lugar en 1863. Sin embargo, la muerte del comerciante ese mismo año interrumpió el proyecto, y sus herederos se negaron a continuar la construcción, transfiriéndola a un monasterio femenino. Se recibieron fondos adicionales de comerciantes de Troitsk, como I. Vasilyev y K. Syromyatnikov.

El 16 de junio de 1862, el Santo Sínodo autorizó la construcción de un nuevo templo monástico para el monasterio de Kazán, la iglesia de la Transfiguración del Señor. La colocación se llevó a cabo el 9 de junio de 1863 bajo la dirección del protoiereo de la catedral de la Santa Trinidad, Gavriil Amanatsky. La construcción duró cuatro años y fue financiada por donaciones privadas de los habitantes de Troitsk: el comerciante I. Vasilyev donó 10 mil rublos, las viudas de comerciantes E. Bakakina y E. Tatarinova, 6 y 2.3 mil rublos respectivamente, y también se recibieron fondos del alcalde V. Pupyshev. En el verano de 1870, la construcción fue completada. El templo se convirtió en la estructura más grande del monasterio de Kazán y representa un estilo clásico de cruz y cúpula. Su característica arquitectónica, que se eleva hacia arriba, hace que el edificio parezca ligero y etéreo. En el templo se instalaron cinco cruces doradas, un iconostasio tallado y dorado de tres niveles, y en la cúpula se representan cuatro ángeles flotantes. La iluminación se proporcionaba mediante un candelabro de cobre plateado y lámparas de plata, y el templo estaba ricamente decorado con 89 íconos. El 1 de octubre de 1870, se llevó a cabo su consagración en presencia del conde Berg, ayudante de campo de Su Majestad Imperial. Antes de la ceremonia, se le regaló al templo un ícono del Gran Mártir y Sanador Pantaleón en un marco dorado tallado.

El 22 de julio de 1891, el heredero Nicolás, futuro emperador Nicolás II, visitó Troitsk y el templo monástico de la Transfiguración del Señor, regalando al templo un ícono de San Nicolás el Milagroso, que se conserva allí hasta hoy.

En los primeros años del poder soviético, el monasterio continuó su actividad, pero en 1922 fue cerrado, al igual que muchas instituciones religiosas. En 1927, los edificios del monasterio fueron transferidos para fines culturales y educativos, y desde entonces sus propietarios han cambiado en varias ocasiones. En tiempos de paz, aquí se encontraban las 47ª y 48ª brigadas de caballería, durante la Gran Guerra Patriótica, una escuela de aviación militar, y en 1947 los edificios fueron transferidos a una escuela técnica de aviación. La iglesia de la Transfiguración del Señor se convirtió en un gimnasio, y la iglesia de Kazán fue desmantelada en 1949.

El primer paso hacia la resurrección del monasterio se dio en 1991, cuando la dirección de la escuela técnica de aviación se dirigió al Consejo de la Iglesia de la iglesia de Dimitrievskaya con la solicitud de aceptar la iglesia de la Transfiguración del Señor en el balance de la iglesia. La comunidad monástica fue recreada en 1996, y la iglesia de la Transfiguración del Señor fue restaurada.