Après la consécration de l'église de la Nativité du Christ, le vénérable Séraphim s'est adressé à M.V. Mantourov en disant : "Nous avons, mon père, construit une église en l'honneur de la Nativité du Sauveur, mais nous n'avons pas d'église en l'honneur de la Vierge ! La Reine des Cieux s'est fâchée contre moi, pauvre Séraphim, et a dit : 'Tu as honoré Mon Fils, mais M' as oublié !' C'est pourquoi j'ai pensé, mon père, ne devrions-nous pas construire une autre église sous le temple ? Efforce-toi, mon père, et nous aurons deux églises." Le vénérable a donné un fil à mesurer, disant que si le souterrain sous l'église de la Nativité du Christ correspondait à la mesure, c'est là qu'il fallait construire l'église en l'honneur de la Nativité de la Mère de Dieu. Le souterrain s'est avéré exact, mais le plafond était bas et nécessitait des colonnes de soutien, et l'église était petite. Mantourov a demandé conseil à Séraphim, qui, rempli de joie, s'est exclamé : "Quatre colonnes, cela signifie que les reliques reposeront ici ! Ce sera une sépulture pour les reliques, mon père !" En 2000, une sépulture pour les reliques des saintes femmes de Diveevo, Alexandra, Martha et Elena, a effectivement été aménagée ici.

La construction de l'église au nom de la Nativité de la Vierge s'est achevée à l'été 1830. Le 8 septembre, l'archimandrite Joakim du monastère de l'Annonciation a consacré le temple, venu à Diveevo malgré l'épidémie de choléra. L'iconostase de l'église était à un étage, semblable à celle de la Nativité du Christ, mais peinte en vert, avec la Crucifixion sur les portes royales. Le temple était chaud, et le sol de l'église inférieure était décoré de carreaux en céramique multicolores, formant un motif rappelant un tapis.

Après la fermeture du monastère, l'église a été utilisée comme entrepôt. La reconsécration de l'église inférieure a eu lieu le 21 octobre 1992, et en 1993, a eu lieu la première tonsure monastique après la réouverture du monastère.

Selon le commandement du vénérable Séraphim, une lampe brûle en permanence près de l'icône de la Nativité de la Vierge, et les sœurs lisent la Psalmodie ininterrompue. En 2008, des chapelles en l'honneur de l'archange Michel et des martyrs royaux ont été ajoutées à l'église. Dans les autels des chapelles inférieures, des tombes de Mikhaïl Vassilievitch Mantourov et du confesseur des sœurs de Diveevo, le prêtre Basil Sadovski, ont été aménagées.

L'église est ornée de fresques du peintre moscovite Konstantin Okhotin, dédiées à la vie terrestre de la Très Sainte Vierge et à l'histoire du monastère de Diveevo. Les chapelles sont peintes par des artistes de l'atelier de Nijni Novgorod "Arche".