L'existence de l'église en l'honneur de Saint Michel Archange à Astrakhan est connue depuis le milieu du XVIIe siècle. Dans des documents de 1672, liés à l'assassinat du métropolite d'Astrakhan, Joseph, il est fait mention d'un « plancher en bois du prêtre de l'église de Saint Michel Archange ». L'église se trouvait dans la ville de Terre, dans l'un des faubourgs des arquebusiers, situés le long du mur sud de la ville blanche. Ce faubourg, connu sous le nom de Zmiev, du nom d'un colonel des arquebusiers, était le plus oriental et jouxtait le mur de la ville de Terre, où se trouvaient les portes de l'Archange. À la fin du XVIIe siècle, des Arméniens commencèrent à s'installer près du faubourg de Zmiev, pour qui un hôpital en pierre fut construit. Après le soulèvement des arquebusiers de 1705-1706, la plupart des maisons dans le faubourg de Zmiev devinrent vides, et les Arméniens l'occupèrent bientôt entièrement. Depuis le début du XVIIIe siècle, les mentions de l'église en bois de Saint Michel Archange à cet endroit disparaissent. Son histoire ultérieure est liée au faubourg de Yamgurcha, nommé ainsi en l'honneur du dernier khan d'Astrakhan, Yamgurcha, ou d'un influent mourza nogaï.

Le faubourg russe de l'autre côté de la rivière Koutoum est apparu au début du XVIIIe siècle. Le colonel Mikhaïl Lebedev y construisit un hôpital de régiment, où se trouva une église en bois en l'honneur de l'icône de la Mère de Dieu « Consolation de tous ceux qui sont dans la douleur ». En 1727, l'église brûla. À la moitié du siècle, le faubourg de Yamgurcha devint peuplé. Il abritait des casernes pour les soldats du bataillon linéaire du Caucase, puis pour le régiment cosaque. Le faubourg se transforma en un lieu militaire, mais une population artisanale significative y vivait également. Les habitants commencèrent à discuter de la construction de leur propre église et attirèrent l'attention sur l'ancienne église de la Résurrection.

L'église de la Résurrection fut construite dans le faubourg des arquebusiers de Kazan au milieu du XVIIe siècle. Les premières mentions à son sujet datent de 1672. Le faubourg de Kazan est probablement apparu à Astrakhan plus tôt, lorsque les arquebusiers s'installèrent dans la ville de Terre. Après le soulèvement de Stenka Razin, un régiment de soldats y fut envoyé. À la fin du XVIIe siècle, le nombre de soldats à Astrakhan augmenta, et ils continuèrent à s'installer dans le faubourg de Kazan, tandis que de nouveaux faubourgs militaires apparaissaient. En 1697, une église en l'honneur de la Protection de la Mère de Dieu est mentionnée dans le faubourg de Kazan, probablement comme chapelle. En 1747, l'église de la Résurrection avait une chapelle en l'honneur de la Protection de la Mère de Dieu. Dans les « Chroniques de Kliouchariev », il est dit qu'en 1722, le gouverneur Artemy Petrovich Volynsky, attendant l'arrivée de Pierre Ier, ordonna de démolir les maisons en bois dans le kremlin et de déplacer les églises. L'église de la Résurrection fut déplacée et renommée en l'honneur de l'icône de Kazan de la Mère de Dieu, ce qui fit que le faubourg commença à être appelé Kazan. Il est possible que l'église de la Résurrection du kremlin ait été déplacée à l'emplacement de l'ancienne église locale de la Résurrection, qui aurait pu brûler à cause des fréquents incendies à Astrakhan. Cependant, le changement de nom de l'église de la Résurrection en Kazan est probablement incorrect, car le faubourg aurait pu être nommé Kazan en l'honneur d'un régiment de Kazan.

Le temple fut décoré d'images sacrées en 1836. En 1905, de nouveaux murs du temple furent peints, et l'ancienne peinture fut restaurée. Le maître Fiodor Konovitch Moïseïev fabriqua le principal iconostase en 1901, qui était à trois niveaux, d'un travail de sculpture délicat et doré au poliment. Les iconostases des autels latéraux, également dorés au poliment, furent installés en 1905. Ce temple était le seul à Astrakhan avec des représentations sculptées de saints.

En 1923, le temple de Saint Michel Archange fut saisi par les rénovateurs. En 1936, il fut fermé puis détruit.