Se sabe de la existencia de la iglesia en honor a San Miguel Arcángel en Astracán desde mediados del siglo XVII. En documentos de 1672, relacionados con el asesinato del metropolitano de Astracán, José, se menciona "el suelo de madera del sacerdote de la iglesia de San Miguel Arcángel". La iglesia se encontraba en la Ciudad de Tierra, en una de las slobodas de los tiradores, situadas a lo largo de la muralla sur de la Ciudad Blanca. Esta sloboda, conocida como Zmievá, en honor al coronel de tiradores, era la más oriental y estaba adyacente a la muralla de la Ciudad de Tierra, donde se encontraban las Puertas de Arcángel. A finales del siglo XVII, junto a la sloboda Zmievá comenzaron a asentarse armenios, para quienes se construyó un hospicio de piedra. Tras la revuelta de los tiradores de 1705-1706, la mayoría de las casas en la sloboda Zmievá quedaron vacías, y los armenios pronto la poblaron por completo. Desde principios del siglo XVIII, las menciones a la iglesia de madera de San Miguel Arcángel en este lugar desaparecen. Su historia posterior está relacionada con la sloboda Yamgurchéva, nombrada así en honor al último kan de Astracán, Yamgurché, o un influyente murza nogaya.

La sloboda rusa al otro lado del río Kutum apareció a principios del siglo XVIII. El coronel Mijaíl Lebedev construyó aquí un hospital de regimiento, donde se alojó una iglesia de madera en honor a la imagen de la Madre de Dios "Consuelo de Todos los Afligidos". En 1727, la iglesia se incendió. Para mediados de siglo, la sloboda Yamgurchéva se había vuelto muy poblada. Aquí había cuarteles para soldados del batallón lineal del Cáucaso, y más tarde para un regimiento cosaco. La sloboda se convirtió en un lugar militar, pero también residía una considerable población civil dedicada a oficios. Los habitantes comenzaron a discutir la construcción de su propia iglesia y prestaron atención a la antigua iglesia de la Resurrección.

La iglesia de la Resurrección fue construida en la sloboda de tiradores de Kazán a mediados del siglo XVII. Las primeras menciones de ella datan de 1672. La sloboda de Kazán probablemente apareció en Astracán antes, cuando los tiradores se asentaban en la Ciudad de Tierra. Tras la revuelta de Stenka Razin, se envió un regimiento de soldados aquí. A finales del siglo XVII, el número de soldados en Astracán aumentó, y continuaron asentándose en la sloboda de Kazán, y más tarde aparecieron nuevas slobodas militares. En 1697, se menciona en la sloboda de Kazán una iglesia en honor a la Protección de la Madre de Dios, probablemente una capilla. En 1747, la iglesia de la Resurrección tenía una capilla en honor a la Protección de la Madre de Dios. En la "Crónica de Kliucharev" se dice que en 1722 el gobernador Artemio Petrovich Volynski, esperando la llegada de Pedro I, ordenó demoler las casas de madera en el kremlin y trasladar las iglesias. La iglesia de la Resurrección fue trasladada y renombrada en honor a la imagen de Kazán de la Madre de Dios, por lo que la sloboda pasó a llamarse Kazán. Es posible que la iglesia de la Resurrección del kremlin se hubiera trasladado al lugar de la antigua iglesia local de la Resurrección, que pudo haberse quemado debido a los frecuentes incendios en Astracán. Sin embargo, el renombramiento de la iglesia de la Resurrección a Kazán probablemente sea incorrecto, ya que la sloboda podría haberse llamado Kazán en honor al regimiento de Kazán.

El templo fue decorado con imágenes sagradas en 1836. En 1905, se pintaron nuevas paredes del templo, y la antigua pintura fue renovada. El iconostasio principal, fabricado por el maestro Fyodor Konovich Moiseyev en 1901, era de tres niveles, de delicada talla y dorado al policromado. Los iconostacios de los altares laterales, también dorados al policromado, fueron instalados en 1905. Este templo fue el único en Astracán con imágenes escultóricas de santos.

En 1923, el templo de San Miguel Arcángel fue tomado por los renovadores. En 1936, fue cerrado y luego volado.