La première mention de l'église dédiée à l'archange Michel date de 1616. À l'origine, elle était en bois, mais elle a brûlé en 1697. En 1781, à cet endroit, sur la bénédiction de l'évêque de Tobolsk et de Sibérie Varlaam I, on a commencé à construire une église en pierre à deux niveaux. Au départ, il était prévu qu'elle soit de plain-pied avec une chapelle en l'honneur de saint Jean Baptiste, mais au cours de la construction, il a été décidé de faire deux étages. Au premier étage, on a installé une église chaude au nom de l'archistratège Michel, consacrée en 1791, et au deuxième, une église froide en l'honneur de Jean Baptiste, consacrée en 1824.

Entre 1898 et 1899, une chapelle nord de plain-pied a été construite, consacrée en l'honneur du saint juste Siméon de Verkhoturye, le patron de la Sibérie.

En 1911, l'église a été visitée deux fois par l'évêque de Tobolsk et de Sibérie Evsevi Grzodov. En 1920, le temple a été fermé pour les services, et en 1922, par décret du VTsIK, plus de 5 puds d'argenterie et de pierres précieuses ont été retirés. Depuis les années 1930, le bâtiment a été utilisé comme club, bureau, garage et entrepôts. En 1934, les coupoles ont été enlevées et le clocher a été démoli. Entre 1940 et 1960, le portique de l'entrée principale et l'escalier menant au deuxième étage ont été démontés. En 1941, le temple est devenu une blanchisserie de garnison, et en 1945, une cantine et un dortoir. Plus tard, le bâtiment a abrité l'usine n°769 et des bureaux de diverses organisations.

Depuis 1976, l'église est protégée par l'État en tant que monument historique et culturel d'importance régionale.

En 1991, des travaux de réparation et de restauration ont commencé, et le temple a commencé à être progressivement restitué à l'Église orthodoxe russe.

En 1997, la responsabilité de la restauration du temple a été confiée au prêtre Nicolas Egorov. Depuis lors, des travaux de restauration de la base, du clocher, des coupoles et des voûtes ont été réalisés. En 1998, l'aménagement intérieur de la chapelle supérieure a commencé et la construction de l'escalier menant au deuxième étage. Les fresques murales de la seconde moitié du XIXe siècle et du début du XXe siècle ont été nettoyées.

En 1999, lors de la fête patronale du 21 novembre, le premier service a eu lieu dans la chapelle de l'archange Michel. En 2000, le prêtre Nicolas Egorov est devenu le recteur du temple.

Grâce aux efforts de la paroisse, une restauration complète du temple a été réalisée, des travaux de plâtrage intérieurs et extérieurs ont été effectués, des croix dorées ont été installées, un vestibule a été construit et des iconostases ont été fabriquées. Un système de chauffage et d'éclairage a été créé, des sols en bois et en marbre ont été installés, ainsi que de nouveaux blocs de fenêtres et de portes. En 2005, de nouvelles cloches ont été consacrées et installées sur le clocher restauré.

La paroisse possède une chapelle dédiée au saint juste Lazare de quatre jours au cimetière de Chervishevskoïe à Tyumen, consacrée en 2003. L'église a été construite par Evseyev Anatoly Vassilievitch.