Le village de Frolovskoye, auparavant connu sous le nom de Florovskoye, est l'un des plus anciens établissements du district de Yuriev. Il est mentionné dans le testament spirituel de 1389 du grand prince Dmitri Ivanovitch Donskoy, qui l'a légué à sa femme, la princesse Evdokiya Dmitrievna. De leur mariage sont nés huit fils : Daniil, Vasily, Yuri, Semyon, Andrei, Pyotr, Ivan et Konstantin, ainsi que quatre filles : Sofia, Maria, Anastasia et Anna. L'aîné des fils, le grand prince Vasily Dmitrievitch, a échangé le village avec sa mère et en 1426 l'a légué à sa femme, la princesse Sofia Vitovtovna, fille du grand prince lituanien Vitovt, avec qui il s'est marié en 1391. Ils ont eu cinq fils : Yuri, Ivan, Daniil, Semyon et Vasily, et quatre filles : Anna, Anastasia, Maria et Vasilisa. En 1462, le grand prince Vasily Vasilievitch a légué le village à sa femme Maria Yaroslavovna. Après sa mort, le village a été possédé par leur fils cadet, le prince Boris Vasilievitch Volotski. En 1471, Boris a épousé la princesse Ulyana Mikhailovna, fille du prince féodal de Kholm, Mikhail Dmitrievitch. Ils ont eu des fils Fyodor et Ivan. Au début du XVIe siècle, le village est passé à Fyodor Borisovitch, fils du prince Boris, qui est mort sans enfants. Après sa mort, le village a été géré par sa veuve Maria. Florovskoye est resté un village de palais jusqu'en 1691, lorsqu'il a été transféré aux boyards Petr et Vasily Abramovitch Lopukhins.

L'église de Florovskoye existait depuis le XIVe siècle. En 1628, des documents du bureau des affaires patriarcales mentionnent « l'église de Jean Baptiste dans le village de palais de Frolovskoye ». En 1691, elle était décrite comme « vétuste ». En 1828, l'église en bois a brûlé à cause d'un coup de foudre, et la même année, la construction d'une église en pierre a commencé. L'actuelle église en pierre de Saint Apôtre et Évangéliste Jean Baptiste, avec des chapelles de l'icône de la Mère de Dieu de Kazan et de Saint Nicolas de Myre, a été consacrée en 1838. Le clocher en pierre a été construit en 1852.

À l'époque soviétique, le temple a été fermé et saccagé, sa toiture, son autel, son clocher et sa clôture ont été détruits.