Le village de Kubaïevo est situé sur la rivière Kenge, à 10 kilomètres de Youriev. Au XVIe siècle, selon les livres patriarcaux de 1645-1647, il était la propriété des nobles Korobov. En 1570, Vassili Vassilievitch Korobov a vendu Kubaïevo au monastère de la Trinité-Saint-Serge pour 600 roubles. La même année, le 3 juin, la stariça Alexandra Sitskaïa a acquis le village pour 400 roubles, mais après sa mort, il est redevenu la propriété du monastère et est resté ainsi jusqu'en 1764. Les livres patriarcaux indiquent qu'en 1593, il y avait une église en bois dans le village au nom des Saints Boris et Gleb, avec des icônes monastiques, des livres et des bougies. Près de l'église se trouvaient la cour du prêtre, une praskournitsa, une prosvirnitsa, 15 foyers paysans et 10 foyers de boubil, ainsi que 20 tcheti de terres agricoles de l'église et 15 fauchés de foin.

Dans les livres de l'Ordre patriarcal de 1628, dans la section sur les propriétés du monastère de la Trinité-Saint-Serge, l'église de Boris et Gleb à Kubaïevo est mentionnée avec un tribut de sept altyns et trois altyns de dîme. En 1654, par une nouvelle lettre et une inspection, le tribut a été augmenté à un rouble et 25 altyns. En 1698, avec la bénédiction du métropolite d'Iourié, Hilarion, les paroissiens ont construit une nouvelle église en bois à l'emplacement de l'ancienne. En 1788, elle a été reconstruite : la table a été élargie, les porches sud ont été enlevés, une fenêtre semi-circulaire a été percée au sud, des porches aveugles ont été réalisés au nord, trois fenêtres rondes sont apparues dans l'église, le bâtiment a été recouvert de planches, et le dôme a été couvert de tôle.

En 1855, grâce aux fonds des paroissiens, la construction d'une église en pierre a commencé. En 1856, un autel chaud a été construit et consacré en l'honneur du Saint Précepteur Serge de Radonège, et en 1860, la construction et la consécration de l'église froide avec le principal autel en l'honneur des Saints Boris et Gleb ont été achevées. Le clocher en pierre, construit en 1850, a survécu jusqu'à nos jours, bien qu'il ait été fermé et détruit pendant l'époque soviétique, et que la clôture ait été ruinée. L'église conserve un ancien antimins en toile, consacré en 1696 par le métropolite Hilarion.